Protein–RNA interactions for Protein: P08100

RHO, Rhodopsin, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOP08100 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RHOP08100 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
RHOP08100 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RHOP08100 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RHOP08100 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
RHOP08100 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
RHOP08100 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
RHOP08100 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
RHOP08100 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
RHOP08100 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
RHOP08100 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
RHOP08100 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RHOP08100 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RHOP08100 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RHOP08100 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RHOP08100 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RHOP08100 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RHOP08100 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RHOP08100 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RHOP08100 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RHOP08100 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RHOP08100 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RHOP08100 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RHOP08100 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
RHOP08100 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RHOP08100 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RHOP08100 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RHOP08100 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RHOP08100 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RHOP08100 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RHOP08100 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RHOP08100 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RHOP08100 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RHOP08100 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RHOP08100 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RHOP08100 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RHOP08100 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RHOP08100 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RHOP08100 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RHOP08100 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RHOP08100 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RHOP08100 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RHOP08100 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RHOP08100 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RHOP08100 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RHOP08100 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RHOP08100 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RHOP08100 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RHOP08100 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RHOP08100 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RHOP08100 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RHOP08100 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RHOP08100 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RHOP08100 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RHOP08100 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RHOP08100 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RHOP08100 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RHOP08100 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RHOP08100 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RHOP08100 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RHOP08100 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RHOP08100 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RHOP08100 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RHOP08100 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RHOP08100 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RHOP08100 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RHOP08100 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RHOP08100 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RHOP08100 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RHOP08100 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RHOP08100 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RHOP08100 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
RHOP08100 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RHOP08100 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RHOP08100 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RHOP08100 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RHOP08100 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RHOP08100 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RHOP08100 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RHOP08100 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RHOP08100 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
RHOP08100 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
RHOP08100 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
RHOP08100 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RHOP08100 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
RHOP08100 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RHOP08100 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RHOP08100 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RHOP08100 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RHOP08100 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RHOP08100 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RHOP08100 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RHOP08100 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RHOP08100 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RHOP08100 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RHOP08100 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RHOP08100 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
RHOP08100 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RHOP08100 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RHOP08100 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms