Protein–RNA interactions for Protein: P05546

SERPIND1, Heparin cofactor 2, humanhuman

Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERPIND1P05546 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SERPIND1P05546 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SERPIND1P05546 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SERPIND1P05546 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SERPIND1P05546 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SERPIND1P05546 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SERPIND1P05546 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SERPIND1P05546 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SERPIND1P05546 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SERPIND1P05546 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SERPIND1P05546 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SERPIND1P05546 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SERPIND1P05546 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SERPIND1P05546 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SERPIND1P05546 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SERPIND1P05546 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SERPIND1P05546 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SERPIND1P05546 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SERPIND1P05546 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SERPIND1P05546 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SERPIND1P05546 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SERPIND1P05546 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SERPIND1P05546 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SERPIND1P05546 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SERPIND1P05546 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SERPIND1P05546 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SERPIND1P05546 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SERPIND1P05546 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SERPIND1P05546 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SERPIND1P05546 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SERPIND1P05546 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SERPIND1P05546 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SERPIND1P05546 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SERPIND1P05546 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SERPIND1P05546 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SERPIND1P05546 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SERPIND1P05546 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SERPIND1P05546 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SERPIND1P05546 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SERPIND1P05546 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SERPIND1P05546 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SERPIND1P05546 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SERPIND1P05546 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SERPIND1P05546 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SERPIND1P05546 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SERPIND1P05546 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SERPIND1P05546 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SERPIND1P05546 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SERPIND1P05546 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SERPIND1P05546 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SERPIND1P05546 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SERPIND1P05546 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SERPIND1P05546 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SERPIND1P05546 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SERPIND1P05546 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SERPIND1P05546 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SERPIND1P05546 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SERPIND1P05546 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SERPIND1P05546 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SERPIND1P05546 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SERPIND1P05546 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SERPIND1P05546 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SERPIND1P05546 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SERPIND1P05546 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SERPIND1P05546 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SERPIND1P05546 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SERPIND1P05546 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SERPIND1P05546 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SERPIND1P05546 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SERPIND1P05546 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SERPIND1P05546 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SERPIND1P05546 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SERPIND1P05546 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SERPIND1P05546 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SERPIND1P05546 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SERPIND1P05546 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SERPIND1P05546 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SERPIND1P05546 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SERPIND1P05546 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SERPIND1P05546 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SERPIND1P05546 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SERPIND1P05546 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SERPIND1P05546 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SERPIND1P05546 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SERPIND1P05546 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SERPIND1P05546 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SERPIND1P05546 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SERPIND1P05546 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SERPIND1P05546 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
SERPIND1P05546 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SERPIND1P05546 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
SERPIND1P05546 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SERPIND1P05546 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SERPIND1P05546 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SERPIND1P05546 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SERPIND1P05546 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SERPIND1P05546 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SERPIND1P05546 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SERPIND1P05546 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SERPIND1P05546 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms