Protein–RNA interactions for Protein: P01009

SERPINA1, Alpha-1-antitrypsin, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERPINA1P01009 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SERPINA1P01009 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SERPINA1P01009 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SERPINA1P01009 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SERPINA1P01009 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SERPINA1P01009 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SERPINA1P01009 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SERPINA1P01009 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SERPINA1P01009 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SERPINA1P01009 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SERPINA1P01009 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SERPINA1P01009 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SERPINA1P01009 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SERPINA1P01009 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SERPINA1P01009 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SERPINA1P01009 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SERPINA1P01009 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SERPINA1P01009 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SERPINA1P01009 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SERPINA1P01009 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SERPINA1P01009 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SERPINA1P01009 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SERPINA1P01009 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SERPINA1P01009 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SERPINA1P01009 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SERPINA1P01009 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SERPINA1P01009 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SERPINA1P01009 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SERPINA1P01009 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SERPINA1P01009 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SERPINA1P01009 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SERPINA1P01009 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SERPINA1P01009 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SERPINA1P01009 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SERPINA1P01009 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SERPINA1P01009 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SERPINA1P01009 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SERPINA1P01009 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SERPINA1P01009 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SERPINA1P01009 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SERPINA1P01009 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SERPINA1P01009 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SERPINA1P01009 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SERPINA1P01009 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SERPINA1P01009 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SERPINA1P01009 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SERPINA1P01009 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SERPINA1P01009 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SERPINA1P01009 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SERPINA1P01009 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SERPINA1P01009 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SERPINA1P01009 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SERPINA1P01009 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SERPINA1P01009 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SERPINA1P01009 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SERPINA1P01009 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SERPINA1P01009 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SERPINA1P01009 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SERPINA1P01009 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SERPINA1P01009 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SERPINA1P01009 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SERPINA1P01009 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SERPINA1P01009 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SERPINA1P01009 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SERPINA1P01009 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SERPINA1P01009 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SERPINA1P01009 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SERPINA1P01009 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SERPINA1P01009 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SERPINA1P01009 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SERPINA1P01009 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SERPINA1P01009 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SERPINA1P01009 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SERPINA1P01009 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SERPINA1P01009 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SERPINA1P01009 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SERPINA1P01009 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SERPINA1P01009 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SERPINA1P01009 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SERPINA1P01009 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SERPINA1P01009 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SERPINA1P01009 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SERPINA1P01009 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SERPINA1P01009 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SERPINA1P01009 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SERPINA1P01009 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SERPINA1P01009 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SERPINA1P01009 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SERPINA1P01009 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SERPINA1P01009 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SERPINA1P01009 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SERPINA1P01009 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SERPINA1P01009 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SERPINA1P01009 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SERPINA1P01009 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SERPINA1P01009 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SERPINA1P01009 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SERPINA1P01009 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SERPINA1P01009 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SERPINA1P01009 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.8 ms