Protein–RNA interactions for Protein: O75563

SKAP2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP2O75563 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SKAP2O75563 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SKAP2O75563 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SKAP2O75563 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SKAP2O75563 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SKAP2O75563 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SKAP2O75563 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SKAP2O75563 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SKAP2O75563 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SKAP2O75563 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SKAP2O75563 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SKAP2O75563 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SKAP2O75563 AC244021.1-201ENST00000417218 3662 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SKAP2O75563 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SKAP2O75563 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SKAP2O75563 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SKAP2O75563 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SKAP2O75563 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SKAP2O75563 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SKAP2O75563 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SKAP2O75563 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SKAP2O75563 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SKAP2O75563 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SKAP2O75563 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SKAP2O75563 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SKAP2O75563 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SKAP2O75563 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SKAP2O75563 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SKAP2O75563 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SKAP2O75563 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SKAP2O75563 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SKAP2O75563 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SKAP2O75563 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SKAP2O75563 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SKAP2O75563 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SKAP2O75563 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SKAP2O75563 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SKAP2O75563 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SKAP2O75563 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SKAP2O75563 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SKAP2O75563 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SKAP2O75563 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SKAP2O75563 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SKAP2O75563 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SKAP2O75563 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SKAP2O75563 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SKAP2O75563 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SKAP2O75563 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SKAP2O75563 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SKAP2O75563 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SKAP2O75563 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SKAP2O75563 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SKAP2O75563 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SKAP2O75563 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SKAP2O75563 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SKAP2O75563 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SKAP2O75563 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SKAP2O75563 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SKAP2O75563 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SKAP2O75563 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SKAP2O75563 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SKAP2O75563 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SKAP2O75563 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SKAP2O75563 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SKAP2O75563 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SKAP2O75563 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SKAP2O75563 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SKAP2O75563 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SKAP2O75563 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SKAP2O75563 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SKAP2O75563 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SKAP2O75563 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SKAP2O75563 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SKAP2O75563 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SKAP2O75563 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SKAP2O75563 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SKAP2O75563 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SKAP2O75563 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SKAP2O75563 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SKAP2O75563 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SKAP2O75563 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SKAP2O75563 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SKAP2O75563 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SKAP2O75563 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SKAP2O75563 MAP3K12-205ENST00000547488 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SKAP2O75563 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SKAP2O75563 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SKAP2O75563 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SKAP2O75563 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SKAP2O75563 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SKAP2O75563 RBM26-203ENST00000438737 4132 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SKAP2O75563 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SKAP2O75563 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SKAP2O75563 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SKAP2O75563 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SKAP2O75563 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SKAP2O75563 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SKAP2O75563 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SKAP2O75563 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SKAP2O75563 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms