Protein–RNA interactions for Protein: O60765

ZNF354A, Zinc finger protein 354A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 605 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF354AO60765 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF354AO60765 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF354AO60765 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF354AO60765 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF354AO60765 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF354AO60765 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF354AO60765 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF354AO60765 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF354AO60765 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF354AO60765 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF354AO60765 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF354AO60765 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF354AO60765 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF354AO60765 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF354AO60765 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF354AO60765 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF354AO60765 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF354AO60765 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF354AO60765 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF354AO60765 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF354AO60765 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF354AO60765 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF354AO60765 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF354AO60765 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF354AO60765 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF354AO60765 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF354AO60765 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF354AO60765 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF354AO60765 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF354AO60765 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF354AO60765 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF354AO60765 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF354AO60765 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF354AO60765 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF354AO60765 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF354AO60765 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF354AO60765 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF354AO60765 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF354AO60765 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF354AO60765 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF354AO60765 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF354AO60765 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF354AO60765 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF354AO60765 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF354AO60765 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF354AO60765 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF354AO60765 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF354AO60765 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF354AO60765 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF354AO60765 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF354AO60765 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF354AO60765 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF354AO60765 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF354AO60765 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF354AO60765 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF354AO60765 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF354AO60765 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF354AO60765 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF354AO60765 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF354AO60765 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF354AO60765 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF354AO60765 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF354AO60765 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF354AO60765 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF354AO60765 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF354AO60765 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF354AO60765 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF354AO60765 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF354AO60765 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF354AO60765 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF354AO60765 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF354AO60765 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF354AO60765 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF354AO60765 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF354AO60765 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF354AO60765 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF354AO60765 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF354AO60765 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF354AO60765 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF354AO60765 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF354AO60765 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF354AO60765 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF354AO60765 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF354AO60765 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF354AO60765 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF354AO60765 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF354AO60765 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF354AO60765 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF354AO60765 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF354AO60765 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF354AO60765 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF354AO60765 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF354AO60765 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF354AO60765 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF354AO60765 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF354AO60765 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF354AO60765 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF354AO60765 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF354AO60765 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF354AO60765 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms