Protein–RNA interactions for Protein: O60759

CYTIP, Cytohesin-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYTIPO60759 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CYTIPO60759 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CYTIPO60759 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CYTIPO60759 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CYTIPO60759 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CYTIPO60759 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CYTIPO60759 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CYTIPO60759 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CYTIPO60759 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CYTIPO60759 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CYTIPO60759 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CYTIPO60759 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CYTIPO60759 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CYTIPO60759 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CYTIPO60759 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CYTIPO60759 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CYTIPO60759 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CYTIPO60759 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CYTIPO60759 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CYTIPO60759 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CYTIPO60759 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CYTIPO60759 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CYTIPO60759 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CYTIPO60759 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CYTIPO60759 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CYTIPO60759 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CYTIPO60759 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CYTIPO60759 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
CYTIPO60759 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CYTIPO60759 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CYTIPO60759 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CYTIPO60759 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CYTIPO60759 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
CYTIPO60759 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CYTIPO60759 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CYTIPO60759 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CYTIPO60759 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CYTIPO60759 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CYTIPO60759 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CYTIPO60759 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CYTIPO60759 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CYTIPO60759 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CYTIPO60759 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CYTIPO60759 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CYTIPO60759 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CYTIPO60759 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CYTIPO60759 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CYTIPO60759 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CYTIPO60759 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CYTIPO60759 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CYTIPO60759 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CYTIPO60759 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
CYTIPO60759 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CYTIPO60759 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
CYTIPO60759 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CYTIPO60759 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CYTIPO60759 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CYTIPO60759 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CYTIPO60759 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
CYTIPO60759 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CYTIPO60759 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CYTIPO60759 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CYTIPO60759 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CYTIPO60759 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CYTIPO60759 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CYTIPO60759 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CYTIPO60759 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CYTIPO60759 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CYTIPO60759 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CYTIPO60759 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
CYTIPO60759 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CYTIPO60759 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CYTIPO60759 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CYTIPO60759 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CYTIPO60759 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CYTIPO60759 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
CYTIPO60759 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CYTIPO60759 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CYTIPO60759 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CYTIPO60759 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CYTIPO60759 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CYTIPO60759 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CYTIPO60759 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CYTIPO60759 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CYTIPO60759 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CYTIPO60759 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CYTIPO60759 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CYTIPO60759 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CYTIPO60759 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CYTIPO60759 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CYTIPO60759 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CYTIPO60759 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CYTIPO60759 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CYTIPO60759 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CYTIPO60759 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CYTIPO60759 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CYTIPO60759 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CYTIPO60759 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CYTIPO60759 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CYTIPO60759 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms