Protein–RNA interactions for Protein: O43924

PDE6D, Retinal rod rhodopsin-sensitive cGMP 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit delta, humanhuman

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Length 150 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6DO43924 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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PDE6DO43924 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PDE6DO43924 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
PDE6DO43924 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PDE6DO43924 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
PDE6DO43924 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
PDE6DO43924 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
PDE6DO43924 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
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PDE6DO43924 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.35
PDE6DO43924 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
PDE6DO43924 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PDE6DO43924 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PDE6DO43924 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PDE6DO43924 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PDE6DO43924 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PDE6DO43924 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
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PDE6DO43924 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
PDE6DO43924 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
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PDE6DO43924 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
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PDE6DO43924 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
PDE6DO43924 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
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PDE6DO43924 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PDE6DO43924 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PDE6DO43924 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PDE6DO43924 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
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PDE6DO43924 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
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PDE6DO43924 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
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PDE6DO43924 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PDE6DO43924 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PDE6DO43924 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
PDE6DO43924 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
PDE6DO43924 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
PDE6DO43924 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PDE6DO43924 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
PDE6DO43924 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
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