Protein–RNA interactions for Protein: O00591

GABRP, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit pi, humanhuman

Predictions only

Length 440 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRPO00591 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
GABRPO00591 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
GABRPO00591 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC14.66□□□□□ -0.06
GABRPO00591 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
GABRPO00591 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
GABRPO00591 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
GABRPO00591 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
GABRPO00591 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
GABRPO00591 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
GABRPO00591 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
GABRPO00591 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
GABRPO00591 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
GABRPO00591 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
GABRPO00591 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
GABRPO00591 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
GABRPO00591 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
GABRPO00591 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
GABRPO00591 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
GABRPO00591 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
GABRPO00591 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GABRPO00591 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
GABRPO00591 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GABRPO00591 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GABRPO00591 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GABRPO00591 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GABRPO00591 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GABRPO00591 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
GABRPO00591 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GABRPO00591 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GABRPO00591 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GABRPO00591 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
GABRPO00591 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GABRPO00591 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GABRPO00591 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
GABRPO00591 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
GABRPO00591 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GABRPO00591 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
GABRPO00591 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GABRPO00591 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GABRPO00591 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GABRPO00591 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GABRPO00591 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GABRPO00591 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
GABRPO00591 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GABRPO00591 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GABRPO00591 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
GABRPO00591 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
GABRPO00591 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
GABRPO00591 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
GABRPO00591 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
GABRPO00591 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GABRPO00591 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
GABRPO00591 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
GABRPO00591 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
GABRPO00591 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
GABRPO00591 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
GABRPO00591 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
GABRPO00591 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GABRPO00591 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GABRPO00591 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
GABRPO00591 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GABRPO00591 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GABRPO00591 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GABRPO00591 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GABRPO00591 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
GABRPO00591 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GABRPO00591 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GABRPO00591 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
GABRPO00591 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
GABRPO00591 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GABRPO00591 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GABRPO00591 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GABRPO00591 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GABRPO00591 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
GABRPO00591 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GABRPO00591 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GABRPO00591 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GABRPO00591 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GABRPO00591 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GABRPO00591 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GABRPO00591 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GABRPO00591 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GABRPO00591 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GABRPO00591 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GABRPO00591 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GABRPO00591 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GABRPO00591 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GABRPO00591 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GABRPO00591 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GABRPO00591 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GABRPO00591 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GABRPO00591 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GABRPO00591 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GABRPO00591 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GABRPO00591 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GABRPO00591 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GABRPO00591 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
GABRPO00591 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GABRPO00591 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GABRPO00591 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms