Protein–RNA interactions for Protein: O00124

UBXN8, UBX domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN8O00124 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
UBXN8O00124 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
UBXN8O00124 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
UBXN8O00124 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
UBXN8O00124 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
UBXN8O00124 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
UBXN8O00124 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
UBXN8O00124 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
UBXN8O00124 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
UBXN8O00124 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
UBXN8O00124 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
UBXN8O00124 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
UBXN8O00124 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
UBXN8O00124 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
UBXN8O00124 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
UBXN8O00124 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
UBXN8O00124 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
UBXN8O00124 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
UBXN8O00124 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
UBXN8O00124 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
UBXN8O00124 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
UBXN8O00124 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
UBXN8O00124 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
UBXN8O00124 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
UBXN8O00124 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
UBXN8O00124 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
UBXN8O00124 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
UBXN8O00124 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
UBXN8O00124 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
UBXN8O00124 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
UBXN8O00124 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
UBXN8O00124 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
UBXN8O00124 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
UBXN8O00124 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
UBXN8O00124 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
UBXN8O00124 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
UBXN8O00124 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
UBXN8O00124 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
UBXN8O00124 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
UBXN8O00124 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
UBXN8O00124 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
UBXN8O00124 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
UBXN8O00124 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
UBXN8O00124 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
UBXN8O00124 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
UBXN8O00124 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
UBXN8O00124 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
UBXN8O00124 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
UBXN8O00124 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
UBXN8O00124 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
UBXN8O00124 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
UBXN8O00124 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
UBXN8O00124 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
UBXN8O00124 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
UBXN8O00124 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
UBXN8O00124 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
UBXN8O00124 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
UBXN8O00124 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
UBXN8O00124 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
UBXN8O00124 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
UBXN8O00124 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
UBXN8O00124 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
UBXN8O00124 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
UBXN8O00124 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
UBXN8O00124 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
UBXN8O00124 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
UBXN8O00124 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
UBXN8O00124 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
UBXN8O00124 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
UBXN8O00124 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
UBXN8O00124 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
UBXN8O00124 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
UBXN8O00124 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
UBXN8O00124 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
UBXN8O00124 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
UBXN8O00124 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
UBXN8O00124 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
UBXN8O00124 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
UBXN8O00124 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
UBXN8O00124 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
UBXN8O00124 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
UBXN8O00124 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
UBXN8O00124 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
UBXN8O00124 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
UBXN8O00124 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
UBXN8O00124 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
UBXN8O00124 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
UBXN8O00124 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
UBXN8O00124 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
UBXN8O00124 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
UBXN8O00124 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
UBXN8O00124 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
UBXN8O00124 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
UBXN8O00124 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
UBXN8O00124 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
UBXN8O00124 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
UBXN8O00124 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
UBXN8O00124 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
UBXN8O00124 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
UBXN8O00124 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms