Protein–RNA interactions for Protein: H3BPF8

GOLGA8S, Golgin A8 family member S, humanhuman

Predictions only

Length 625 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA8SH3BPF8 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
GOLGA8SH3BPF8 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GOLGA8SH3BPF8 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GOLGA8SH3BPF8 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GOLGA8SH3BPF8 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GOLGA8SH3BPF8 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GOLGA8SH3BPF8 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GOLGA8SH3BPF8 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GOLGA8SH3BPF8 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GOLGA8SH3BPF8 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GOLGA8SH3BPF8 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GOLGA8SH3BPF8 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GOLGA8SH3BPF8 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GOLGA8SH3BPF8 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GOLGA8SH3BPF8 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
GOLGA8SH3BPF8 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GOLGA8SH3BPF8 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GOLGA8SH3BPF8 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GOLGA8SH3BPF8 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GOLGA8SH3BPF8 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GOLGA8SH3BPF8 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GOLGA8SH3BPF8 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GOLGA8SH3BPF8 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GOLGA8SH3BPF8 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GOLGA8SH3BPF8 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GOLGA8SH3BPF8 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GOLGA8SH3BPF8 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GOLGA8SH3BPF8 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GOLGA8SH3BPF8 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GOLGA8SH3BPF8 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GOLGA8SH3BPF8 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GOLGA8SH3BPF8 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GOLGA8SH3BPF8 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GOLGA8SH3BPF8 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GOLGA8SH3BPF8 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GOLGA8SH3BPF8 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GOLGA8SH3BPF8 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
GOLGA8SH3BPF8 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GOLGA8SH3BPF8 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GOLGA8SH3BPF8 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GOLGA8SH3BPF8 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GOLGA8SH3BPF8 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GOLGA8SH3BPF8 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GOLGA8SH3BPF8 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GOLGA8SH3BPF8 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GOLGA8SH3BPF8 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GOLGA8SH3BPF8 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GOLGA8SH3BPF8 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GOLGA8SH3BPF8 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GOLGA8SH3BPF8 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GOLGA8SH3BPF8 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GOLGA8SH3BPF8 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
GOLGA8SH3BPF8 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GOLGA8SH3BPF8 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GOLGA8SH3BPF8 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GOLGA8SH3BPF8 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GOLGA8SH3BPF8 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GOLGA8SH3BPF8 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GOLGA8SH3BPF8 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GOLGA8SH3BPF8 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GOLGA8SH3BPF8 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GOLGA8SH3BPF8 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GOLGA8SH3BPF8 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GOLGA8SH3BPF8 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GOLGA8SH3BPF8 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GOLGA8SH3BPF8 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GOLGA8SH3BPF8 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GOLGA8SH3BPF8 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GOLGA8SH3BPF8 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GOLGA8SH3BPF8 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GOLGA8SH3BPF8 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GOLGA8SH3BPF8 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GOLGA8SH3BPF8 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GOLGA8SH3BPF8 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GOLGA8SH3BPF8 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GOLGA8SH3BPF8 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GOLGA8SH3BPF8 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GOLGA8SH3BPF8 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GOLGA8SH3BPF8 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GOLGA8SH3BPF8 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GOLGA8SH3BPF8 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GOLGA8SH3BPF8 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GOLGA8SH3BPF8 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
GOLGA8SH3BPF8 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GOLGA8SH3BPF8 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GOLGA8SH3BPF8 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GOLGA8SH3BPF8 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GOLGA8SH3BPF8 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GOLGA8SH3BPF8 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GOLGA8SH3BPF8 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GOLGA8SH3BPF8 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GOLGA8SH3BPF8 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GOLGA8SH3BPF8 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GOLGA8SH3BPF8 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GOLGA8SH3BPF8 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GOLGA8SH3BPF8 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GOLGA8SH3BPF8 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GOLGA8SH3BPF8 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GOLGA8SH3BPF8 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GOLGA8SH3BPF8 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.2 ms