Protein–RNA interactions for Protein: E9PCH4

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,651 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E9PCH4 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
E9PCH4 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
E9PCH4 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
E9PCH4 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
E9PCH4 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
E9PCH4 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
E9PCH4 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
E9PCH4 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
E9PCH4 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
E9PCH4 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
E9PCH4 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
E9PCH4 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
E9PCH4 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
E9PCH4 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
E9PCH4 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
E9PCH4 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
E9PCH4 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
E9PCH4 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
E9PCH4 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
E9PCH4 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
E9PCH4 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
E9PCH4 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
E9PCH4 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
E9PCH4 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
E9PCH4 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
E9PCH4 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
E9PCH4 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
E9PCH4 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
E9PCH4 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
E9PCH4 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
E9PCH4 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
E9PCH4 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
E9PCH4 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
E9PCH4 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
E9PCH4 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
E9PCH4 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
E9PCH4 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
E9PCH4 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
E9PCH4 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
E9PCH4 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
E9PCH4 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
E9PCH4 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
E9PCH4 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
E9PCH4 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
E9PCH4 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
E9PCH4 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
E9PCH4 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
E9PCH4 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
E9PCH4 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
E9PCH4 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
E9PCH4 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
E9PCH4 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
E9PCH4 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
E9PCH4 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
E9PCH4 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
E9PCH4 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
E9PCH4 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
E9PCH4 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
E9PCH4 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
E9PCH4 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
E9PCH4 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
E9PCH4 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
E9PCH4 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
E9PCH4 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
E9PCH4 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
E9PCH4 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
E9PCH4 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
E9PCH4 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
E9PCH4 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
E9PCH4 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
E9PCH4 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
E9PCH4 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
E9PCH4 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
E9PCH4 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
E9PCH4 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
E9PCH4 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
E9PCH4 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
E9PCH4 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
E9PCH4 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
E9PCH4 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
E9PCH4 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
E9PCH4 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
E9PCH4 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
E9PCH4 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
E9PCH4 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
E9PCH4 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
E9PCH4 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
E9PCH4 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
E9PCH4 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
E9PCH4 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
E9PCH4 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
E9PCH4 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
E9PCH4 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
E9PCH4 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
E9PCH4 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
E9PCH4 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
E9PCH4 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
E9PCH4 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
E9PCH4 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
E9PCH4 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms