Protein–RNA interactions for Protein: A6NGH7

CCDC160, Coiled-coil domain-containing protein 160, humanhuman

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC160A6NGH7 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC160A6NGH7 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC160A6NGH7 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC160A6NGH7 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC160A6NGH7 NEU3-201ENST00000294064 6728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC160A6NGH7 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC160A6NGH7 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC160A6NGH7 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC160A6NGH7 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC160A6NGH7 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC160A6NGH7 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC160A6NGH7 THBS2-206ENST00000617924 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC160A6NGH7 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC160A6NGH7 SH3BP5L-201ENST00000366472 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC160A6NGH7 MTA3-202ENST00000405592 5832 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC160A6NGH7 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC160A6NGH7 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC160A6NGH7 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC160A6NGH7 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC160A6NGH7 ZFYVE28-211ENST00000515312 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC160A6NGH7 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC160A6NGH7 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC160A6NGH7 RPS6KC1-206ENST00000543354 4082 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC160A6NGH7 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC160A6NGH7 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC160A6NGH7 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC160A6NGH7 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC160A6NGH7 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC160A6NGH7 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC160A6NGH7 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC160A6NGH7 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC160A6NGH7 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC160A6NGH7 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC160A6NGH7 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC160A6NGH7 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC160A6NGH7 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC160A6NGH7 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC160A6NGH7 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC160A6NGH7 SLC4A7-207ENST00000437179 3667 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC160A6NGH7 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC160A6NGH7 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC160A6NGH7 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC160A6NGH7 TMEM87B-201ENST00000283206 5212 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC160A6NGH7 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC160A6NGH7 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC160A6NGH7 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC160A6NGH7 VPS26B-201ENST00000281187 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC160A6NGH7 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC160A6NGH7 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC160A6NGH7 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC160A6NGH7 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC160A6NGH7 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC160A6NGH7 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC160A6NGH7 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC160A6NGH7 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC160A6NGH7 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC160A6NGH7 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC160A6NGH7 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC160A6NGH7 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC160A6NGH7 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC160A6NGH7 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC160A6NGH7 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC160A6NGH7 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC160A6NGH7 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC160A6NGH7 MRC2-202ENST00000446119 3201 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC160A6NGH7 NR3C1-201ENST00000231509 3556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC160A6NGH7 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC160A6NGH7 CELSR1-201ENST00000262738 11389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC160A6NGH7 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC160A6NGH7 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC160A6NGH7 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC160A6NGH7 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC160A6NGH7 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC160A6NGH7 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC160A6NGH7 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC160A6NGH7 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC160A6NGH7 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC160A6NGH7 CX3CL1-204ENST00000565912 5796 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC160A6NGH7 ADCYAP1R1-201ENST00000304166 6487 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC160A6NGH7 XPR1-201ENST00000367589 4126 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC160A6NGH7 GALNT3-201ENST00000392701 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC160A6NGH7 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC160A6NGH7 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC160A6NGH7 CNTN2-201ENST00000331830 7999 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC160A6NGH7 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC160A6NGH7 NUTM2E-201ENST00000429984 3292 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC160A6NGH7 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
CCDC160A6NGH7 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CCDC160A6NGH7 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CCDC160A6NGH7 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CCDC160A6NGH7 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CCDC160A6NGH7 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
CCDC160A6NGH7 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CCDC160A6NGH7 GAB2-202ENST00000361507 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CCDC160A6NGH7 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CCDC160A6NGH7 RGS12-204ENST00000382788 5512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CCDC160A6NGH7 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC160A6NGH7 PCDHGB7-201ENST00000398594 4765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC160A6NGH7 OCRL-202ENST00000371113 5162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC160A6NGH7 SRGAP3-201ENST00000360413 8415 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.1 ms