Protein–RNA interactions for Protein: A6NEF3

GOLGA6L4, Golgin subfamily A member 6-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6L4A6NEF3 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GOLGA6L4A6NEF3 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GOLGA6L4A6NEF3 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GOLGA6L4A6NEF3 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GOLGA6L4A6NEF3 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
GOLGA6L4A6NEF3 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GOLGA6L4A6NEF3 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GOLGA6L4A6NEF3 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GOLGA6L4A6NEF3 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GOLGA6L4A6NEF3 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GOLGA6L4A6NEF3 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GOLGA6L4A6NEF3 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GOLGA6L4A6NEF3 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GOLGA6L4A6NEF3 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GOLGA6L4A6NEF3 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GOLGA6L4A6NEF3 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GOLGA6L4A6NEF3 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GOLGA6L4A6NEF3 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GOLGA6L4A6NEF3 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
GOLGA6L4A6NEF3 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GOLGA6L4A6NEF3 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GOLGA6L4A6NEF3 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GOLGA6L4A6NEF3 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GOLGA6L4A6NEF3 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GOLGA6L4A6NEF3 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GOLGA6L4A6NEF3 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GOLGA6L4A6NEF3 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
GOLGA6L4A6NEF3 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GOLGA6L4A6NEF3 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GOLGA6L4A6NEF3 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GOLGA6L4A6NEF3 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GOLGA6L4A6NEF3 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GOLGA6L4A6NEF3 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GOLGA6L4A6NEF3 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GOLGA6L4A6NEF3 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GOLGA6L4A6NEF3 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GOLGA6L4A6NEF3 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GOLGA6L4A6NEF3 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GOLGA6L4A6NEF3 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GOLGA6L4A6NEF3 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GOLGA6L4A6NEF3 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GOLGA6L4A6NEF3 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GOLGA6L4A6NEF3 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GOLGA6L4A6NEF3 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GOLGA6L4A6NEF3 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GOLGA6L4A6NEF3 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GOLGA6L4A6NEF3 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GOLGA6L4A6NEF3 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GOLGA6L4A6NEF3 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GOLGA6L4A6NEF3 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
GOLGA6L4A6NEF3 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GOLGA6L4A6NEF3 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GOLGA6L4A6NEF3 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GOLGA6L4A6NEF3 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GOLGA6L4A6NEF3 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
GOLGA6L4A6NEF3 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
GOLGA6L4A6NEF3 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GOLGA6L4A6NEF3 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GOLGA6L4A6NEF3 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GOLGA6L4A6NEF3 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GOLGA6L4A6NEF3 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GOLGA6L4A6NEF3 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GOLGA6L4A6NEF3 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GOLGA6L4A6NEF3 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GOLGA6L4A6NEF3 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GOLGA6L4A6NEF3 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GOLGA6L4A6NEF3 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GOLGA6L4A6NEF3 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GOLGA6L4A6NEF3 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GOLGA6L4A6NEF3 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GOLGA6L4A6NEF3 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GOLGA6L4A6NEF3 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GOLGA6L4A6NEF3 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GOLGA6L4A6NEF3 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GOLGA6L4A6NEF3 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GOLGA6L4A6NEF3 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GOLGA6L4A6NEF3 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GOLGA6L4A6NEF3 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GOLGA6L4A6NEF3 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GOLGA6L4A6NEF3 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GOLGA6L4A6NEF3 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GOLGA6L4A6NEF3 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GOLGA6L4A6NEF3 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GOLGA6L4A6NEF3 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GOLGA6L4A6NEF3 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
GOLGA6L4A6NEF3 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
GOLGA6L4A6NEF3 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
GOLGA6L4A6NEF3 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GOLGA6L4A6NEF3 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GOLGA6L4A6NEF3 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GOLGA6L4A6NEF3 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GOLGA6L4A6NEF3 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GOLGA6L4A6NEF3 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GOLGA6L4A6NEF3 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GOLGA6L4A6NEF3 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GOLGA6L4A6NEF3 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GOLGA6L4A6NEF3 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
GOLGA6L4A6NEF3 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
GOLGA6L4A6NEF3 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GOLGA6L4A6NEF3 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms