Protein–RNA interactions for Protein: A4FU01

MTMR11, Myotubularin-related protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 709 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR11A4FU01 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MTMR11A4FU01 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MTMR11A4FU01 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MTMR11A4FU01 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MTMR11A4FU01 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MTMR11A4FU01 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MTMR11A4FU01 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MTMR11A4FU01 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MTMR11A4FU01 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MTMR11A4FU01 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MTMR11A4FU01 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MTMR11A4FU01 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
MTMR11A4FU01 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MTMR11A4FU01 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MTMR11A4FU01 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MTMR11A4FU01 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MTMR11A4FU01 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MTMR11A4FU01 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MTMR11A4FU01 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MTMR11A4FU01 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MTMR11A4FU01 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MTMR11A4FU01 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MTMR11A4FU01 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MTMR11A4FU01 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MTMR11A4FU01 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MTMR11A4FU01 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MTMR11A4FU01 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MTMR11A4FU01 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MTMR11A4FU01 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MTMR11A4FU01 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
MTMR11A4FU01 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MTMR11A4FU01 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MTMR11A4FU01 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MTMR11A4FU01 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MTMR11A4FU01 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MTMR11A4FU01 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MTMR11A4FU01 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MTMR11A4FU01 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MTMR11A4FU01 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MTMR11A4FU01 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MTMR11A4FU01 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MTMR11A4FU01 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MTMR11A4FU01 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MTMR11A4FU01 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MTMR11A4FU01 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MTMR11A4FU01 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MTMR11A4FU01 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MTMR11A4FU01 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MTMR11A4FU01 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MTMR11A4FU01 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MTMR11A4FU01 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MTMR11A4FU01 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MTMR11A4FU01 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MTMR11A4FU01 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MTMR11A4FU01 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MTMR11A4FU01 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MTMR11A4FU01 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MTMR11A4FU01 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MTMR11A4FU01 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MTMR11A4FU01 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MTMR11A4FU01 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MTMR11A4FU01 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MTMR11A4FU01 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MTMR11A4FU01 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MTMR11A4FU01 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
MTMR11A4FU01 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
MTMR11A4FU01 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
MTMR11A4FU01 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
MTMR11A4FU01 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MTMR11A4FU01 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MTMR11A4FU01 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MTMR11A4FU01 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MTMR11A4FU01 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MTMR11A4FU01 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MTMR11A4FU01 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MTMR11A4FU01 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MTMR11A4FU01 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MTMR11A4FU01 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MTMR11A4FU01 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MTMR11A4FU01 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MTMR11A4FU01 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MTMR11A4FU01 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MTMR11A4FU01 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MTMR11A4FU01 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MTMR11A4FU01 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MTMR11A4FU01 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MTMR11A4FU01 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MTMR11A4FU01 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MTMR11A4FU01 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MTMR11A4FU01 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MTMR11A4FU01 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MTMR11A4FU01 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MTMR11A4FU01 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MTMR11A4FU01 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MTMR11A4FU01 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MTMR11A4FU01 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MTMR11A4FU01 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MTMR11A4FU01 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MTMR11A4FU01 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MTMR11A4FU01 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms