Protein–RNA interactions for Protein: R4GMW8

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BIVM-ERCC5R4GMW8 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
BIVM-ERCC5R4GMW8 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
BIVM-ERCC5R4GMW8 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
BIVM-ERCC5R4GMW8 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
BIVM-ERCC5R4GMW8 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
BIVM-ERCC5R4GMW8 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
BIVM-ERCC5R4GMW8 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
BIVM-ERCC5R4GMW8 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
BIVM-ERCC5R4GMW8 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
BIVM-ERCC5R4GMW8 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
BIVM-ERCC5R4GMW8 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
BIVM-ERCC5R4GMW8 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
BIVM-ERCC5R4GMW8 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
BIVM-ERCC5R4GMW8 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
BIVM-ERCC5R4GMW8 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
BIVM-ERCC5R4GMW8 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
BIVM-ERCC5R4GMW8 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
BIVM-ERCC5R4GMW8 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
BIVM-ERCC5R4GMW8 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
BIVM-ERCC5R4GMW8 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
BIVM-ERCC5R4GMW8 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
BIVM-ERCC5R4GMW8 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
BIVM-ERCC5R4GMW8 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
BIVM-ERCC5R4GMW8 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
BIVM-ERCC5R4GMW8 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
BIVM-ERCC5R4GMW8 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
BIVM-ERCC5R4GMW8 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
BIVM-ERCC5R4GMW8 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
BIVM-ERCC5R4GMW8 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
BIVM-ERCC5R4GMW8 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
BIVM-ERCC5R4GMW8 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
BIVM-ERCC5R4GMW8 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
BIVM-ERCC5R4GMW8 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
BIVM-ERCC5R4GMW8 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
BIVM-ERCC5R4GMW8 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
BIVM-ERCC5R4GMW8 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
BIVM-ERCC5R4GMW8 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
BIVM-ERCC5R4GMW8 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
BIVM-ERCC5R4GMW8 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
BIVM-ERCC5R4GMW8 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
BIVM-ERCC5R4GMW8 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
BIVM-ERCC5R4GMW8 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
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BIVM-ERCC5R4GMW8 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
BIVM-ERCC5R4GMW8 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
BIVM-ERCC5R4GMW8 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
BIVM-ERCC5R4GMW8 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
BIVM-ERCC5R4GMW8 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
BIVM-ERCC5R4GMW8 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
BIVM-ERCC5R4GMW8 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
BIVM-ERCC5R4GMW8 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
BIVM-ERCC5R4GMW8 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
BIVM-ERCC5R4GMW8 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
BIVM-ERCC5R4GMW8 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
BIVM-ERCC5R4GMW8 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
BIVM-ERCC5R4GMW8 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
BIVM-ERCC5R4GMW8 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
BIVM-ERCC5R4GMW8 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
BIVM-ERCC5R4GMW8 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
BIVM-ERCC5R4GMW8 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
BIVM-ERCC5R4GMW8 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
BIVM-ERCC5R4GMW8 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
BIVM-ERCC5R4GMW8 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
BIVM-ERCC5R4GMW8 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
BIVM-ERCC5R4GMW8 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
BIVM-ERCC5R4GMW8 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
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BIVM-ERCC5R4GMW8 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
BIVM-ERCC5R4GMW8 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
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BIVM-ERCC5R4GMW8 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
BIVM-ERCC5R4GMW8 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
BIVM-ERCC5R4GMW8 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
BIVM-ERCC5R4GMW8 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
BIVM-ERCC5R4GMW8 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
BIVM-ERCC5R4GMW8 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
BIVM-ERCC5R4GMW8 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
BIVM-ERCC5R4GMW8 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
BIVM-ERCC5R4GMW8 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
BIVM-ERCC5R4GMW8 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
BIVM-ERCC5R4GMW8 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
BIVM-ERCC5R4GMW8 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
BIVM-ERCC5R4GMW8 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
BIVM-ERCC5R4GMW8 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
BIVM-ERCC5R4GMW8 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
BIVM-ERCC5R4GMW8 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
BIVM-ERCC5R4GMW8 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
BIVM-ERCC5R4GMW8 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
BIVM-ERCC5R4GMW8 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
BIVM-ERCC5R4GMW8 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
BIVM-ERCC5R4GMW8 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
BIVM-ERCC5R4GMW8 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
BIVM-ERCC5R4GMW8 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
BIVM-ERCC5R4GMW8 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
BIVM-ERCC5R4GMW8 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
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