Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4D7

PLXND1, Plexin-D1, humanhuman

Predictions only

Length 1,925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXND1Q9Y4D7 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
PLXND1Q9Y4D7 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.19
PLXND1Q9Y4D7 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.19
PLXND1Q9Y4D7 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
PLXND1Q9Y4D7 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
PLXND1Q9Y4D7 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PLXND1Q9Y4D7 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PLXND1Q9Y4D7 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PLXND1Q9Y4D7 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PLXND1Q9Y4D7 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PLXND1Q9Y4D7 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
PLXND1Q9Y4D7 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.19
PLXND1Q9Y4D7 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
PLXND1Q9Y4D7 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
PLXND1Q9Y4D7 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
PLXND1Q9Y4D7 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
PLXND1Q9Y4D7 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PLXND1Q9Y4D7 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PLXND1Q9Y4D7 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
PLXND1Q9Y4D7 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PLXND1Q9Y4D7 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PLXND1Q9Y4D7 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PLXND1Q9Y4D7 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PLXND1Q9Y4D7 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PLXND1Q9Y4D7 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PLXND1Q9Y4D7 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PLXND1Q9Y4D7 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
PLXND1Q9Y4D7 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PLXND1Q9Y4D7 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
PLXND1Q9Y4D7 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PLXND1Q9Y4D7 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PLXND1Q9Y4D7 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PLXND1Q9Y4D7 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PLXND1Q9Y4D7 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PLXND1Q9Y4D7 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PLXND1Q9Y4D7 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PLXND1Q9Y4D7 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PLXND1Q9Y4D7 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
PLXND1Q9Y4D7 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
PLXND1Q9Y4D7 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
PLXND1Q9Y4D7 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PLXND1Q9Y4D7 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
PLXND1Q9Y4D7 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PLXND1Q9Y4D7 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PLXND1Q9Y4D7 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PLXND1Q9Y4D7 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PLXND1Q9Y4D7 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PLXND1Q9Y4D7 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PLXND1Q9Y4D7 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PLXND1Q9Y4D7 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PLXND1Q9Y4D7 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
PLXND1Q9Y4D7 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PLXND1Q9Y4D7 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PLXND1Q9Y4D7 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PLXND1Q9Y4D7 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PLXND1Q9Y4D7 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PLXND1Q9Y4D7 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PLXND1Q9Y4D7 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PLXND1Q9Y4D7 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PLXND1Q9Y4D7 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PLXND1Q9Y4D7 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PLXND1Q9Y4D7 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PLXND1Q9Y4D7 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PLXND1Q9Y4D7 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PLXND1Q9Y4D7 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PLXND1Q9Y4D7 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PLXND1Q9Y4D7 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PLXND1Q9Y4D7 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PLXND1Q9Y4D7 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PLXND1Q9Y4D7 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PLXND1Q9Y4D7 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PLXND1Q9Y4D7 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PLXND1Q9Y4D7 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
PLXND1Q9Y4D7 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PLXND1Q9Y4D7 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PLXND1Q9Y4D7 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
PLXND1Q9Y4D7 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PLXND1Q9Y4D7 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PLXND1Q9Y4D7 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PLXND1Q9Y4D7 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PLXND1Q9Y4D7 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PLXND1Q9Y4D7 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
PLXND1Q9Y4D7 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PLXND1Q9Y4D7 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PLXND1Q9Y4D7 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PLXND1Q9Y4D7 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PLXND1Q9Y4D7 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PLXND1Q9Y4D7 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PLXND1Q9Y4D7 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PLXND1Q9Y4D7 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PLXND1Q9Y4D7 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PLXND1Q9Y4D7 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PLXND1Q9Y4D7 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PLXND1Q9Y4D7 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PLXND1Q9Y4D7 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PLXND1Q9Y4D7 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PLXND1Q9Y4D7 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PLXND1Q9Y4D7 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PLXND1Q9Y4D7 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PLXND1Q9Y4D7 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms