Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3L3

SH3BP1, SH3 domain-binding protein 1, humanhuman

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Length 701 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1Q9Y3L3 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SH3BP1Q9Y3L3 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SH3BP1Q9Y3L3 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SH3BP1Q9Y3L3 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SH3BP1Q9Y3L3 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SH3BP1Q9Y3L3 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SH3BP1Q9Y3L3 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SH3BP1Q9Y3L3 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SH3BP1Q9Y3L3 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SH3BP1Q9Y3L3 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SH3BP1Q9Y3L3 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SH3BP1Q9Y3L3 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SH3BP1Q9Y3L3 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SH3BP1Q9Y3L3 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SH3BP1Q9Y3L3 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SH3BP1Q9Y3L3 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SH3BP1Q9Y3L3 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SH3BP1Q9Y3L3 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SH3BP1Q9Y3L3 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SH3BP1Q9Y3L3 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SH3BP1Q9Y3L3 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SH3BP1Q9Y3L3 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SH3BP1Q9Y3L3 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SH3BP1Q9Y3L3 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
SH3BP1Q9Y3L3 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SH3BP1Q9Y3L3 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SH3BP1Q9Y3L3 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SH3BP1Q9Y3L3 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SH3BP1Q9Y3L3 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SH3BP1Q9Y3L3 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
SH3BP1Q9Y3L3 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SH3BP1Q9Y3L3 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SH3BP1Q9Y3L3 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SH3BP1Q9Y3L3 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SH3BP1Q9Y3L3 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SH3BP1Q9Y3L3 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SH3BP1Q9Y3L3 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SH3BP1Q9Y3L3 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SH3BP1Q9Y3L3 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SH3BP1Q9Y3L3 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SH3BP1Q9Y3L3 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SH3BP1Q9Y3L3 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SH3BP1Q9Y3L3 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SH3BP1Q9Y3L3 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SH3BP1Q9Y3L3 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SH3BP1Q9Y3L3 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SH3BP1Q9Y3L3 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SH3BP1Q9Y3L3 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SH3BP1Q9Y3L3 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SH3BP1Q9Y3L3 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SH3BP1Q9Y3L3 THSD4-201ENST00000261862 3133 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SH3BP1Q9Y3L3 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SH3BP1Q9Y3L3 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
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SH3BP1Q9Y3L3 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SH3BP1Q9Y3L3 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
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SH3BP1Q9Y3L3 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SH3BP1Q9Y3L3 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
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SH3BP1Q9Y3L3 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
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SH3BP1Q9Y3L3 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
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SH3BP1Q9Y3L3 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
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SH3BP1Q9Y3L3 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SH3BP1Q9Y3L3 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
SH3BP1Q9Y3L3 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SH3BP1Q9Y3L3 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
SH3BP1Q9Y3L3 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SH3BP1Q9Y3L3 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SH3BP1Q9Y3L3 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SH3BP1Q9Y3L3 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
SH3BP1Q9Y3L3 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SH3BP1Q9Y3L3 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SH3BP1Q9Y3L3 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SH3BP1Q9Y3L3 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SH3BP1Q9Y3L3 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SH3BP1Q9Y3L3 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SH3BP1Q9Y3L3 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SH3BP1Q9Y3L3 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SH3BP1Q9Y3L3 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SH3BP1Q9Y3L3 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SH3BP1Q9Y3L3 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SH3BP1Q9Y3L3 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SH3BP1Q9Y3L3 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SH3BP1Q9Y3L3 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
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