Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2I6

NINL, Ninein-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NINLQ9Y2I6 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NINLQ9Y2I6 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NINLQ9Y2I6 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
NINLQ9Y2I6 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NINLQ9Y2I6 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NINLQ9Y2I6 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NINLQ9Y2I6 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NINLQ9Y2I6 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NINLQ9Y2I6 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NINLQ9Y2I6 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NINLQ9Y2I6 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NINLQ9Y2I6 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
NINLQ9Y2I6 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
NINLQ9Y2I6 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NINLQ9Y2I6 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NINLQ9Y2I6 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NINLQ9Y2I6 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NINLQ9Y2I6 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NINLQ9Y2I6 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NINLQ9Y2I6 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NINLQ9Y2I6 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NINLQ9Y2I6 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NINLQ9Y2I6 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
NINLQ9Y2I6 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
NINLQ9Y2I6 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
NINLQ9Y2I6 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NINLQ9Y2I6 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NINLQ9Y2I6 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
NINLQ9Y2I6 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NINLQ9Y2I6 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NINLQ9Y2I6 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
NINLQ9Y2I6 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
NINLQ9Y2I6 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NINLQ9Y2I6 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NINLQ9Y2I6 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NINLQ9Y2I6 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NINLQ9Y2I6 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NINLQ9Y2I6 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NINLQ9Y2I6 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NINLQ9Y2I6 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NINLQ9Y2I6 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NINLQ9Y2I6 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NINLQ9Y2I6 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NINLQ9Y2I6 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NINLQ9Y2I6 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NINLQ9Y2I6 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NINLQ9Y2I6 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NINLQ9Y2I6 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NINLQ9Y2I6 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NINLQ9Y2I6 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NINLQ9Y2I6 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NINLQ9Y2I6 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NINLQ9Y2I6 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NINLQ9Y2I6 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
NINLQ9Y2I6 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
NINLQ9Y2I6 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NINLQ9Y2I6 PARP8-218ENST00000513738 596 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NINLQ9Y2I6 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NINLQ9Y2I6 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NINLQ9Y2I6 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NINLQ9Y2I6 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NINLQ9Y2I6 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NINLQ9Y2I6 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NINLQ9Y2I6 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NINLQ9Y2I6 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NINLQ9Y2I6 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NINLQ9Y2I6 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NINLQ9Y2I6 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NINLQ9Y2I6 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NINLQ9Y2I6 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NINLQ9Y2I6 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NINLQ9Y2I6 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NINLQ9Y2I6 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NINLQ9Y2I6 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NINLQ9Y2I6 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NINLQ9Y2I6 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NINLQ9Y2I6 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NINLQ9Y2I6 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NINLQ9Y2I6 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NINLQ9Y2I6 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NINLQ9Y2I6 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NINLQ9Y2I6 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NINLQ9Y2I6 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NINLQ9Y2I6 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
NINLQ9Y2I6 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NINLQ9Y2I6 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NINLQ9Y2I6 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NINLQ9Y2I6 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NINLQ9Y2I6 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NINLQ9Y2I6 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NINLQ9Y2I6 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NINLQ9Y2I6 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NINLQ9Y2I6 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NINLQ9Y2I6 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NINLQ9Y2I6 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NINLQ9Y2I6 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NINLQ9Y2I6 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NINLQ9Y2I6 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NINLQ9Y2I6 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NINLQ9Y2I6 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.3 ms