Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y234

LIPT1, Lipoyltransferase 1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIPT1Q9Y234 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LIPT1Q9Y234 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LIPT1Q9Y234 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LIPT1Q9Y234 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LIPT1Q9Y234 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LIPT1Q9Y234 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LIPT1Q9Y234 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LIPT1Q9Y234 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LIPT1Q9Y234 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LIPT1Q9Y234 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LIPT1Q9Y234 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LIPT1Q9Y234 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LIPT1Q9Y234 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LIPT1Q9Y234 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LIPT1Q9Y234 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LIPT1Q9Y234 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LIPT1Q9Y234 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LIPT1Q9Y234 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LIPT1Q9Y234 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LIPT1Q9Y234 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LIPT1Q9Y234 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LIPT1Q9Y234 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
LIPT1Q9Y234 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
LIPT1Q9Y234 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LIPT1Q9Y234 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LIPT1Q9Y234 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LIPT1Q9Y234 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LIPT1Q9Y234 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LIPT1Q9Y234 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
LIPT1Q9Y234 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
LIPT1Q9Y234 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LIPT1Q9Y234 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LIPT1Q9Y234 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LIPT1Q9Y234 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LIPT1Q9Y234 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LIPT1Q9Y234 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LIPT1Q9Y234 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LIPT1Q9Y234 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LIPT1Q9Y234 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LIPT1Q9Y234 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LIPT1Q9Y234 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LIPT1Q9Y234 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LIPT1Q9Y234 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LIPT1Q9Y234 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LIPT1Q9Y234 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LIPT1Q9Y234 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LIPT1Q9Y234 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LIPT1Q9Y234 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LIPT1Q9Y234 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LIPT1Q9Y234 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LIPT1Q9Y234 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
LIPT1Q9Y234 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
LIPT1Q9Y234 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LIPT1Q9Y234 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LIPT1Q9Y234 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LIPT1Q9Y234 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
LIPT1Q9Y234 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LIPT1Q9Y234 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LIPT1Q9Y234 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LIPT1Q9Y234 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LIPT1Q9Y234 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LIPT1Q9Y234 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LIPT1Q9Y234 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
LIPT1Q9Y234 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
LIPT1Q9Y234 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LIPT1Q9Y234 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
LIPT1Q9Y234 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LIPT1Q9Y234 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LIPT1Q9Y234 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LIPT1Q9Y234 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
LIPT1Q9Y234 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
LIPT1Q9Y234 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
LIPT1Q9Y234 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LIPT1Q9Y234 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LIPT1Q9Y234 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LIPT1Q9Y234 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LIPT1Q9Y234 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LIPT1Q9Y234 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LIPT1Q9Y234 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LIPT1Q9Y234 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LIPT1Q9Y234 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LIPT1Q9Y234 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LIPT1Q9Y234 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
LIPT1Q9Y234 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LIPT1Q9Y234 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LIPT1Q9Y234 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LIPT1Q9Y234 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LIPT1Q9Y234 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LIPT1Q9Y234 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LIPT1Q9Y234 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LIPT1Q9Y234 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
LIPT1Q9Y234 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LIPT1Q9Y234 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LIPT1Q9Y234 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LIPT1Q9Y234 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LIPT1Q9Y234 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LIPT1Q9Y234 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LIPT1Q9Y234 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LIPT1Q9Y234 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LIPT1Q9Y234 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms