Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNH6

SNX7, Sorting nexin-7, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX7Q9UNH6 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNX7Q9UNH6 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNX7Q9UNH6 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNX7Q9UNH6 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNX7Q9UNH6 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SNX7Q9UNH6 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNX7Q9UNH6 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNX7Q9UNH6 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNX7Q9UNH6 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNX7Q9UNH6 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNX7Q9UNH6 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNX7Q9UNH6 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNX7Q9UNH6 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNX7Q9UNH6 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNX7Q9UNH6 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNX7Q9UNH6 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNX7Q9UNH6 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNX7Q9UNH6 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNX7Q9UNH6 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNX7Q9UNH6 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNX7Q9UNH6 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNX7Q9UNH6 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNX7Q9UNH6 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNX7Q9UNH6 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNX7Q9UNH6 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNX7Q9UNH6 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNX7Q9UNH6 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNX7Q9UNH6 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNX7Q9UNH6 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNX7Q9UNH6 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SNX7Q9UNH6 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNX7Q9UNH6 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNX7Q9UNH6 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNX7Q9UNH6 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNX7Q9UNH6 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNX7Q9UNH6 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SNX7Q9UNH6 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNX7Q9UNH6 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNX7Q9UNH6 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNX7Q9UNH6 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SNX7Q9UNH6 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNX7Q9UNH6 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNX7Q9UNH6 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNX7Q9UNH6 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNX7Q9UNH6 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNX7Q9UNH6 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNX7Q9UNH6 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNX7Q9UNH6 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNX7Q9UNH6 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNX7Q9UNH6 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNX7Q9UNH6 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNX7Q9UNH6 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNX7Q9UNH6 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNX7Q9UNH6 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNX7Q9UNH6 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNX7Q9UNH6 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNX7Q9UNH6 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNX7Q9UNH6 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNX7Q9UNH6 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNX7Q9UNH6 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SNX7Q9UNH6 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNX7Q9UNH6 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNX7Q9UNH6 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNX7Q9UNH6 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNX7Q9UNH6 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNX7Q9UNH6 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNX7Q9UNH6 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNX7Q9UNH6 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNX7Q9UNH6 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNX7Q9UNH6 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNX7Q9UNH6 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNX7Q9UNH6 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNX7Q9UNH6 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNX7Q9UNH6 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNX7Q9UNH6 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNX7Q9UNH6 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNX7Q9UNH6 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNX7Q9UNH6 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNX7Q9UNH6 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SNX7Q9UNH6 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNX7Q9UNH6 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNX7Q9UNH6 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNX7Q9UNH6 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNX7Q9UNH6 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNX7Q9UNH6 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNX7Q9UNH6 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNX7Q9UNH6 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SNX7Q9UNH6 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNX7Q9UNH6 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SNX7Q9UNH6 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNX7Q9UNH6 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNX7Q9UNH6 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNX7Q9UNH6 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNX7Q9UNH6 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SNX7Q9UNH6 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNX7Q9UNH6 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNX7Q9UNH6 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNX7Q9UNH6 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNX7Q9UNH6 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNX7Q9UNH6 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.2 ms