Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL19

RARRES3, Retinoic acid receptor responder protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 164 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RARRES3Q9UL19 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RARRES3Q9UL19 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RARRES3Q9UL19 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RARRES3Q9UL19 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RARRES3Q9UL19 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RARRES3Q9UL19 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RARRES3Q9UL19 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RARRES3Q9UL19 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RARRES3Q9UL19 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RARRES3Q9UL19 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RARRES3Q9UL19 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RARRES3Q9UL19 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RARRES3Q9UL19 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RARRES3Q9UL19 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RARRES3Q9UL19 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RARRES3Q9UL19 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RARRES3Q9UL19 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RARRES3Q9UL19 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RARRES3Q9UL19 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RARRES3Q9UL19 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RARRES3Q9UL19 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RARRES3Q9UL19 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RARRES3Q9UL19 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RARRES3Q9UL19 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RARRES3Q9UL19 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RARRES3Q9UL19 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RARRES3Q9UL19 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RARRES3Q9UL19 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RARRES3Q9UL19 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RARRES3Q9UL19 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RARRES3Q9UL19 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RARRES3Q9UL19 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RARRES3Q9UL19 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RARRES3Q9UL19 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RARRES3Q9UL19 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
RARRES3Q9UL19 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RARRES3Q9UL19 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RARRES3Q9UL19 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RARRES3Q9UL19 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RARRES3Q9UL19 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RARRES3Q9UL19 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RARRES3Q9UL19 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RARRES3Q9UL19 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RARRES3Q9UL19 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RARRES3Q9UL19 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RARRES3Q9UL19 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RARRES3Q9UL19 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RARRES3Q9UL19 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RARRES3Q9UL19 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RARRES3Q9UL19 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RARRES3Q9UL19 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RARRES3Q9UL19 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RARRES3Q9UL19 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RARRES3Q9UL19 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RARRES3Q9UL19 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RARRES3Q9UL19 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
RARRES3Q9UL19 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RARRES3Q9UL19 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RARRES3Q9UL19 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RARRES3Q9UL19 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
RARRES3Q9UL19 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RARRES3Q9UL19 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RARRES3Q9UL19 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RARRES3Q9UL19 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RARRES3Q9UL19 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RARRES3Q9UL19 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RARRES3Q9UL19 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
RARRES3Q9UL19 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RARRES3Q9UL19 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RARRES3Q9UL19 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
RARRES3Q9UL19 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RARRES3Q9UL19 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RARRES3Q9UL19 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RARRES3Q9UL19 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RARRES3Q9UL19 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RARRES3Q9UL19 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RARRES3Q9UL19 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RARRES3Q9UL19 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RARRES3Q9UL19 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RARRES3Q9UL19 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RARRES3Q9UL19 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RARRES3Q9UL19 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
RARRES3Q9UL19 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RARRES3Q9UL19 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RARRES3Q9UL19 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RARRES3Q9UL19 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RARRES3Q9UL19 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RARRES3Q9UL19 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RARRES3Q9UL19 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RARRES3Q9UL19 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RARRES3Q9UL19 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RARRES3Q9UL19 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RARRES3Q9UL19 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RARRES3Q9UL19 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
RARRES3Q9UL19 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RARRES3Q9UL19 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RARRES3Q9UL19 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RARRES3Q9UL19 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RARRES3Q9UL19 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RARRES3Q9UL19 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms