Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT3

DKK4, Dickkopf-related protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK4Q9UBT3 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DKK4Q9UBT3 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DKK4Q9UBT3 AC007333.1-201ENST00000568286 630 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DKK4Q9UBT3 NAT9-224ENST00000583757 583 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DKK4Q9UBT3 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DKK4Q9UBT3 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
DKK4Q9UBT3 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DKK4Q9UBT3 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DKK4Q9UBT3 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DKK4Q9UBT3 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DKK4Q9UBT3 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DKK4Q9UBT3 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DKK4Q9UBT3 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DKK4Q9UBT3 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DKK4Q9UBT3 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DKK4Q9UBT3 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DKK4Q9UBT3 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DKK4Q9UBT3 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DKK4Q9UBT3 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DKK4Q9UBT3 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DKK4Q9UBT3 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DKK4Q9UBT3 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DKK4Q9UBT3 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DKK4Q9UBT3 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DKK4Q9UBT3 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DKK4Q9UBT3 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DKK4Q9UBT3 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DKK4Q9UBT3 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DKK4Q9UBT3 BOLA3-201ENST00000295326 444 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DKK4Q9UBT3 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DKK4Q9UBT3 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DKK4Q9UBT3 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DKK4Q9UBT3 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
DKK4Q9UBT3 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DKK4Q9UBT3 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DKK4Q9UBT3 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DKK4Q9UBT3 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DKK4Q9UBT3 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
DKK4Q9UBT3 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DKK4Q9UBT3 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DKK4Q9UBT3 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DKK4Q9UBT3 AC016629.1-201ENST00000596579 586 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
DKK4Q9UBT3 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DKK4Q9UBT3 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DKK4Q9UBT3 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
DKK4Q9UBT3 SNX1-214ENST00000625244 324 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DKK4Q9UBT3 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DKK4Q9UBT3 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DKK4Q9UBT3 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DKK4Q9UBT3 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DKK4Q9UBT3 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DKK4Q9UBT3 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DKK4Q9UBT3 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DKK4Q9UBT3 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DKK4Q9UBT3 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DKK4Q9UBT3 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DKK4Q9UBT3 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
DKK4Q9UBT3 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DKK4Q9UBT3 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
DKK4Q9UBT3 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
DKK4Q9UBT3 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
DKK4Q9UBT3 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
DKK4Q9UBT3 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DKK4Q9UBT3 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DKK4Q9UBT3 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
DKK4Q9UBT3 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
DKK4Q9UBT3 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DKK4Q9UBT3 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DKK4Q9UBT3 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DKK4Q9UBT3 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
DKK4Q9UBT3 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DKK4Q9UBT3 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
DKK4Q9UBT3 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
DKK4Q9UBT3 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
DKK4Q9UBT3 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DKK4Q9UBT3 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
DKK4Q9UBT3 FXNP2-201ENST00000411625 547 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
DKK4Q9UBT3 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DKK4Q9UBT3 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
DKK4Q9UBT3 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
DKK4Q9UBT3 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
DKK4Q9UBT3 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
DKK4Q9UBT3 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
DKK4Q9UBT3 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
DKK4Q9UBT3 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
DKK4Q9UBT3 RERG-205ENST00000537647 935 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
DKK4Q9UBT3 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
DKK4Q9UBT3 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DKK4Q9UBT3 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
DKK4Q9UBT3 HCG18-245ENST00000602550 559 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
DKK4Q9UBT3 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
DKK4Q9UBT3 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
DKK4Q9UBT3 AL021578.1-201ENST00000613646 709 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
DKK4Q9UBT3 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DKK4Q9UBT3 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
DKK4Q9UBT3 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DKK4Q9UBT3 ACTR2-205ENST00000542850 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DKK4Q9UBT3 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DKK4Q9UBT3 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DKK4Q9UBT3 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms