Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBL6

CPNE7, Copine-7, humanhuman

Predictions only

Length 633 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPNE7Q9UBL6 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CPNE7Q9UBL6 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CPNE7Q9UBL6 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CPNE7Q9UBL6 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CPNE7Q9UBL6 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CPNE7Q9UBL6 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CPNE7Q9UBL6 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CPNE7Q9UBL6 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CPNE7Q9UBL6 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CPNE7Q9UBL6 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CPNE7Q9UBL6 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CPNE7Q9UBL6 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CPNE7Q9UBL6 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CPNE7Q9UBL6 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CPNE7Q9UBL6 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CPNE7Q9UBL6 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CPNE7Q9UBL6 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CPNE7Q9UBL6 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CPNE7Q9UBL6 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CPNE7Q9UBL6 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CPNE7Q9UBL6 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CPNE7Q9UBL6 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CPNE7Q9UBL6 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CPNE7Q9UBL6 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CPNE7Q9UBL6 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CPNE7Q9UBL6 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CPNE7Q9UBL6 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CPNE7Q9UBL6 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CPNE7Q9UBL6 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CPNE7Q9UBL6 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CPNE7Q9UBL6 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CPNE7Q9UBL6 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CPNE7Q9UBL6 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CPNE7Q9UBL6 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CPNE7Q9UBL6 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CPNE7Q9UBL6 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CPNE7Q9UBL6 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CPNE7Q9UBL6 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CPNE7Q9UBL6 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CPNE7Q9UBL6 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CPNE7Q9UBL6 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CPNE7Q9UBL6 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CPNE7Q9UBL6 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CPNE7Q9UBL6 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CPNE7Q9UBL6 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CPNE7Q9UBL6 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CPNE7Q9UBL6 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CPNE7Q9UBL6 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CPNE7Q9UBL6 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CPNE7Q9UBL6 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CPNE7Q9UBL6 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CPNE7Q9UBL6 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CPNE7Q9UBL6 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CPNE7Q9UBL6 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CPNE7Q9UBL6 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CPNE7Q9UBL6 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CPNE7Q9UBL6 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CPNE7Q9UBL6 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CPNE7Q9UBL6 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CPNE7Q9UBL6 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CPNE7Q9UBL6 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CPNE7Q9UBL6 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CPNE7Q9UBL6 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CPNE7Q9UBL6 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CPNE7Q9UBL6 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CPNE7Q9UBL6 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CPNE7Q9UBL6 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CPNE7Q9UBL6 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CPNE7Q9UBL6 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CPNE7Q9UBL6 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CPNE7Q9UBL6 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CPNE7Q9UBL6 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CPNE7Q9UBL6 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CPNE7Q9UBL6 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CPNE7Q9UBL6 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CPNE7Q9UBL6 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CPNE7Q9UBL6 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CPNE7Q9UBL6 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CPNE7Q9UBL6 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CPNE7Q9UBL6 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CPNE7Q9UBL6 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CPNE7Q9UBL6 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CPNE7Q9UBL6 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CPNE7Q9UBL6 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CPNE7Q9UBL6 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CPNE7Q9UBL6 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CPNE7Q9UBL6 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CPNE7Q9UBL6 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CPNE7Q9UBL6 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CPNE7Q9UBL6 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CPNE7Q9UBL6 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CPNE7Q9UBL6 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CPNE7Q9UBL6 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CPNE7Q9UBL6 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CPNE7Q9UBL6 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CPNE7Q9UBL6 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CPNE7Q9UBL6 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CPNE7Q9UBL6 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CPNE7Q9UBL6 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CPNE7Q9UBL6 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms