Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z9

CCDC180, Coiled-coil domain-containing protein 180, humanhuman

Predictions only

Length 1,646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC180Q9P1Z9 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
CCDC180Q9P1Z9 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
CCDC180Q9P1Z9 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC32.94■■■□□ 2.86
CCDC180Q9P1Z9 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
CCDC180Q9P1Z9 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.93■■■□□ 2.86
CCDC180Q9P1Z9 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
CCDC180Q9P1Z9 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
CCDC180Q9P1Z9 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC32.93■■■□□ 2.86
CCDC180Q9P1Z9 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
CCDC180Q9P1Z9 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
CCDC180Q9P1Z9 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
CCDC180Q9P1Z9 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
CCDC180Q9P1Z9 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
CCDC180Q9P1Z9 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC32.93■■■□□ 2.86
CCDC180Q9P1Z9 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC32.93■■■□□ 2.86
CCDC180Q9P1Z9 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC32.93■■■□□ 2.86
CCDC180Q9P1Z9 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
CCDC180Q9P1Z9 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
CCDC180Q9P1Z9 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.93■■■□□ 2.86
CCDC180Q9P1Z9 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC32.93■■■□□ 2.86
CCDC180Q9P1Z9 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
CCDC180Q9P1Z9 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC32.93■■■□□ 2.86
CCDC180Q9P1Z9 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
CCDC180Q9P1Z9 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
CCDC180Q9P1Z9 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC32.92■■■□□ 2.86
CCDC180Q9P1Z9 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC32.92■■■□□ 2.86
CCDC180Q9P1Z9 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
CCDC180Q9P1Z9 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.92■■■□□ 2.86
CCDC180Q9P1Z9 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.92■■■□□ 2.86
CCDC180Q9P1Z9 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC32.92■■■□□ 2.86
CCDC180Q9P1Z9 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC32.92■■■□□ 2.86
CCDC180Q9P1Z9 ZFR2-208ENST00000592398 532 ntTSL 5 BASIC32.92■■■□□ 2.86
CCDC180Q9P1Z9 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
CCDC180Q9P1Z9 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
CCDC180Q9P1Z9 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC32.92■■■□□ 2.86
CCDC180Q9P1Z9 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
CCDC180Q9P1Z9 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC32.92■■■□□ 2.86
CCDC180Q9P1Z9 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
CCDC180Q9P1Z9 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
CCDC180Q9P1Z9 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC32.92■■■□□ 2.86
CCDC180Q9P1Z9 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
CCDC180Q9P1Z9 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
CCDC180Q9P1Z9 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
CCDC180Q9P1Z9 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
CCDC180Q9P1Z9 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
CCDC180Q9P1Z9 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
CCDC180Q9P1Z9 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC32.91■■■□□ 2.86
CCDC180Q9P1Z9 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC32.91■■■□□ 2.86
CCDC180Q9P1Z9 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
CCDC180Q9P1Z9 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
CCDC180Q9P1Z9 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC32.91■■■□□ 2.86
CCDC180Q9P1Z9 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC32.91■■■□□ 2.86
CCDC180Q9P1Z9 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
CCDC180Q9P1Z9 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
CCDC180Q9P1Z9 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
CCDC180Q9P1Z9 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
CCDC180Q9P1Z9 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC32.91■■■□□ 2.86
CCDC180Q9P1Z9 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC32.91■■■□□ 2.86
CCDC180Q9P1Z9 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC32.91■■■□□ 2.86
CCDC180Q9P1Z9 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC32.91■■■□□ 2.86
CCDC180Q9P1Z9 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
CCDC180Q9P1Z9 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC32.91■■■□□ 2.86
CCDC180Q9P1Z9 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
CCDC180Q9P1Z9 AC100858.3-202ENST00000533496 553 ntTSL 4 BASIC32.91■■■□□ 2.86
CCDC180Q9P1Z9 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC32.91■■■□□ 2.86
CCDC180Q9P1Z9 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC32.91■■■□□ 2.86
CCDC180Q9P1Z9 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC32.91■■■□□ 2.86
CCDC180Q9P1Z9 LGALS9C-215ENST00000584941 1104 ntTSL 5 BASIC32.91■■■□□ 2.86
CCDC180Q9P1Z9 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC32.91■■■□□ 2.86
CCDC180Q9P1Z9 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
CCDC180Q9P1Z9 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC32.9■■■□□ 2.86
CCDC180Q9P1Z9 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
CCDC180Q9P1Z9 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
CCDC180Q9P1Z9 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
CCDC180Q9P1Z9 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
CCDC180Q9P1Z9 MAPK14-204ENST00000468133 1376 ntTSL 2 BASIC32.9■■■□□ 2.86
CCDC180Q9P1Z9 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.9■■■□□ 2.86
CCDC180Q9P1Z9 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC32.9■■■□□ 2.86
CCDC180Q9P1Z9 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC32.9■■■□□ 2.86
CCDC180Q9P1Z9 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC32.9■■■□□ 2.86
CCDC180Q9P1Z9 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC32.9■■■□□ 2.86
CCDC180Q9P1Z9 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
CCDC180Q9P1Z9 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.9■■■□□ 2.86
CCDC180Q9P1Z9 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
CCDC180Q9P1Z9 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
CCDC180Q9P1Z9 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
CCDC180Q9P1Z9 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC32.89■■■□□ 2.86
CCDC180Q9P1Z9 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC32.89■■■□□ 2.86
CCDC180Q9P1Z9 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC32.89■■■□□ 2.86
CCDC180Q9P1Z9 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.89■■■□□ 2.86
CCDC180Q9P1Z9 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
CCDC180Q9P1Z9 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC32.89■■■□□ 2.85
CCDC180Q9P1Z9 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
CCDC180Q9P1Z9 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
CCDC180Q9P1Z9 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.88■■■□□ 2.85
CCDC180Q9P1Z9 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC32.88■■■□□ 2.85
CCDC180Q9P1Z9 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC32.88■■■□□ 2.85
CCDC180Q9P1Z9 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
CCDC180Q9P1Z9 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC32.88■■■□□ 2.85
CCDC180Q9P1Z9 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC32.88■■■□□ 2.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms