Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZR2

LRP1B, Low-density lipoprotein receptor-related protein 1B, humanhuman

Predictions only

Length 4,599 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP1BQ9NZR2 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
LRP1BQ9NZR2 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
LRP1BQ9NZR2 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
LRP1BQ9NZR2 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
LRP1BQ9NZR2 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
LRP1BQ9NZR2 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
LRP1BQ9NZR2 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
LRP1BQ9NZR2 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
LRP1BQ9NZR2 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
LRP1BQ9NZR2 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
LRP1BQ9NZR2 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
LRP1BQ9NZR2 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
LRP1BQ9NZR2 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
LRP1BQ9NZR2 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC10.29□□□□□ -0.76
LRP1BQ9NZR2 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
LRP1BQ9NZR2 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
LRP1BQ9NZR2 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
LRP1BQ9NZR2 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
LRP1BQ9NZR2 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.29□□□□□ -0.76
LRP1BQ9NZR2 MIR6727-201ENST00000620702 65 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
LRP1BQ9NZR2 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
LRP1BQ9NZR2 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
LRP1BQ9NZR2 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
LRP1BQ9NZR2 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
LRP1BQ9NZR2 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
LRP1BQ9NZR2 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
LRP1BQ9NZR2 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
LRP1BQ9NZR2 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
LRP1BQ9NZR2 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
LRP1BQ9NZR2 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
LRP1BQ9NZR2 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
LRP1BQ9NZR2 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
LRP1BQ9NZR2 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
LRP1BQ9NZR2 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
LRP1BQ9NZR2 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
LRP1BQ9NZR2 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
LRP1BQ9NZR2 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
LRP1BQ9NZR2 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC10.29□□□□□ -0.76
LRP1BQ9NZR2 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
LRP1BQ9NZR2 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
LRP1BQ9NZR2 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
LRP1BQ9NZR2 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
LRP1BQ9NZR2 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
LRP1BQ9NZR2 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
LRP1BQ9NZR2 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
LRP1BQ9NZR2 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
LRP1BQ9NZR2 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
LRP1BQ9NZR2 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
LRP1BQ9NZR2 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
LRP1BQ9NZR2 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
LRP1BQ9NZR2 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
LRP1BQ9NZR2 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
LRP1BQ9NZR2 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
LRP1BQ9NZR2 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
LRP1BQ9NZR2 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
LRP1BQ9NZR2 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
LRP1BQ9NZR2 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
LRP1BQ9NZR2 KRT8P19-201ENST00000551916 1455 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
LRP1BQ9NZR2 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
LRP1BQ9NZR2 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
LRP1BQ9NZR2 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
LRP1BQ9NZR2 CATSPERZ-203ENST00000539943 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
LRP1BQ9NZR2 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
LRP1BQ9NZR2 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
LRP1BQ9NZR2 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
LRP1BQ9NZR2 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
LRP1BQ9NZR2 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
LRP1BQ9NZR2 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
LRP1BQ9NZR2 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
LRP1BQ9NZR2 GGCT-203ENST00000409144 836 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
LRP1BQ9NZR2 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
LRP1BQ9NZR2 GGCT-201ENST00000005374 1032 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
LRP1BQ9NZR2 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
LRP1BQ9NZR2 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
LRP1BQ9NZR2 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
LRP1BQ9NZR2 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
LRP1BQ9NZR2 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
LRP1BQ9NZR2 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
LRP1BQ9NZR2 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
LRP1BQ9NZR2 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
LRP1BQ9NZR2 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
LRP1BQ9NZR2 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
LRP1BQ9NZR2 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
LRP1BQ9NZR2 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
LRP1BQ9NZR2 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
LRP1BQ9NZR2 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC10.28□□□□□ -0.76
LRP1BQ9NZR2 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
LRP1BQ9NZR2 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
LRP1BQ9NZR2 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
LRP1BQ9NZR2 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
LRP1BQ9NZR2 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
LRP1BQ9NZR2 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
LRP1BQ9NZR2 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
LRP1BQ9NZR2 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
LRP1BQ9NZR2 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
LRP1BQ9NZR2 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
LRP1BQ9NZR2 REEP1-202ENST00000453231 940 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
LRP1BQ9NZR2 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
LRP1BQ9NZR2 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
LRP1BQ9NZR2 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
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