Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY47

CACNA2D2, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D2Q9NY47 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
CACNA2D2Q9NY47 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CACNA2D2Q9NY47 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CACNA2D2Q9NY47 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CACNA2D2Q9NY47 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CACNA2D2Q9NY47 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CACNA2D2Q9NY47 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CACNA2D2Q9NY47 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CACNA2D2Q9NY47 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CACNA2D2Q9NY47 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CACNA2D2Q9NY47 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CACNA2D2Q9NY47 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CACNA2D2Q9NY47 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CACNA2D2Q9NY47 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CACNA2D2Q9NY47 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CACNA2D2Q9NY47 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CACNA2D2Q9NY47 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CACNA2D2Q9NY47 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CACNA2D2Q9NY47 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CACNA2D2Q9NY47 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CACNA2D2Q9NY47 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CACNA2D2Q9NY47 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CACNA2D2Q9NY47 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CACNA2D2Q9NY47 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CACNA2D2Q9NY47 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CACNA2D2Q9NY47 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CACNA2D2Q9NY47 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CACNA2D2Q9NY47 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CACNA2D2Q9NY47 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CACNA2D2Q9NY47 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CACNA2D2Q9NY47 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CACNA2D2Q9NY47 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CACNA2D2Q9NY47 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CACNA2D2Q9NY47 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CACNA2D2Q9NY47 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CACNA2D2Q9NY47 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CACNA2D2Q9NY47 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CACNA2D2Q9NY47 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CACNA2D2Q9NY47 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CACNA2D2Q9NY47 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CACNA2D2Q9NY47 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CACNA2D2Q9NY47 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CACNA2D2Q9NY47 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CACNA2D2Q9NY47 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CACNA2D2Q9NY47 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CACNA2D2Q9NY47 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CACNA2D2Q9NY47 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CACNA2D2Q9NY47 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CACNA2D2Q9NY47 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CACNA2D2Q9NY47 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CACNA2D2Q9NY47 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CACNA2D2Q9NY47 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CACNA2D2Q9NY47 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CACNA2D2Q9NY47 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CACNA2D2Q9NY47 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CACNA2D2Q9NY47 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CACNA2D2Q9NY47 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CACNA2D2Q9NY47 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CACNA2D2Q9NY47 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CACNA2D2Q9NY47 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CACNA2D2Q9NY47 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CACNA2D2Q9NY47 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CACNA2D2Q9NY47 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CACNA2D2Q9NY47 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CACNA2D2Q9NY47 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CACNA2D2Q9NY47 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CACNA2D2Q9NY47 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CACNA2D2Q9NY47 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CACNA2D2Q9NY47 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CACNA2D2Q9NY47 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CACNA2D2Q9NY47 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CACNA2D2Q9NY47 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CACNA2D2Q9NY47 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CACNA2D2Q9NY47 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CACNA2D2Q9NY47 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CACNA2D2Q9NY47 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CACNA2D2Q9NY47 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CACNA2D2Q9NY47 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CACNA2D2Q9NY47 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CACNA2D2Q9NY47 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CACNA2D2Q9NY47 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CACNA2D2Q9NY47 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CACNA2D2Q9NY47 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CACNA2D2Q9NY47 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CACNA2D2Q9NY47 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CACNA2D2Q9NY47 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CACNA2D2Q9NY47 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CACNA2D2Q9NY47 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CACNA2D2Q9NY47 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CACNA2D2Q9NY47 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CACNA2D2Q9NY47 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CACNA2D2Q9NY47 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CACNA2D2Q9NY47 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CACNA2D2Q9NY47 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CACNA2D2Q9NY47 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CACNA2D2Q9NY47 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CACNA2D2Q9NY47 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CACNA2D2Q9NY47 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CACNA2D2Q9NY47 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CACNA2D2Q9NY47 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms