Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX04

C1orf109, Uncharacterized protein C1orf109, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf109Q9NX04 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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C1orf109Q9NX04 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C1orf109Q9NX04 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
C1orf109Q9NX04 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
C1orf109Q9NX04 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
C1orf109Q9NX04 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C1orf109Q9NX04 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C1orf109Q9NX04 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
C1orf109Q9NX04 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C1orf109Q9NX04 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
C1orf109Q9NX04 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C1orf109Q9NX04 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C1orf109Q9NX04 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
C1orf109Q9NX04 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
C1orf109Q9NX04 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C1orf109Q9NX04 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C1orf109Q9NX04 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
C1orf109Q9NX04 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C1orf109Q9NX04 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C1orf109Q9NX04 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
C1orf109Q9NX04 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
C1orf109Q9NX04 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
C1orf109Q9NX04 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C1orf109Q9NX04 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
C1orf109Q9NX04 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.14
C1orf109Q9NX04 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
C1orf109Q9NX04 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
C1orf109Q9NX04 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
C1orf109Q9NX04 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
C1orf109Q9NX04 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
C1orf109Q9NX04 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
C1orf109Q9NX04 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
C1orf109Q9NX04 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
C1orf109Q9NX04 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
C1orf109Q9NX04 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
C1orf109Q9NX04 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
C1orf109Q9NX04 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
C1orf109Q9NX04 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
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C1orf109Q9NX04 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
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C1orf109Q9NX04 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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C1orf109Q9NX04 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
C1orf109Q9NX04 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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C1orf109Q9NX04 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C1orf109Q9NX04 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C1orf109Q9NX04 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C1orf109Q9NX04 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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C1orf109Q9NX04 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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C1orf109Q9NX04 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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C1orf109Q9NX04 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
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C1orf109Q9NX04 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C1orf109Q9NX04 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C1orf109Q9NX04 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
C1orf109Q9NX04 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C1orf109Q9NX04 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
C1orf109Q9NX04 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C1orf109Q9NX04 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
C1orf109Q9NX04 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C1orf109Q9NX04 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
C1orf109Q9NX04 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
C1orf109Q9NX04 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
C1orf109Q9NX04 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C1orf109Q9NX04 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C1orf109Q9NX04 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
C1orf109Q9NX04 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C1orf109Q9NX04 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C1orf109Q9NX04 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
C1orf109Q9NX04 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
C1orf109Q9NX04 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
C1orf109Q9NX04 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
C1orf109Q9NX04 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
C1orf109Q9NX04 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C1orf109Q9NX04 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.2 ms