Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVC6

MED17, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 17, humanhuman

Predictions only

Length 651 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED17Q9NVC6 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MED17Q9NVC6 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MED17Q9NVC6 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MED17Q9NVC6 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MED17Q9NVC6 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MED17Q9NVC6 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MED17Q9NVC6 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MED17Q9NVC6 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MED17Q9NVC6 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MED17Q9NVC6 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MED17Q9NVC6 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MED17Q9NVC6 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MED17Q9NVC6 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MED17Q9NVC6 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MED17Q9NVC6 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MED17Q9NVC6 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MED17Q9NVC6 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MED17Q9NVC6 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MED17Q9NVC6 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MED17Q9NVC6 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
MED17Q9NVC6 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MED17Q9NVC6 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MED17Q9NVC6 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MED17Q9NVC6 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MED17Q9NVC6 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MED17Q9NVC6 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MED17Q9NVC6 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MED17Q9NVC6 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MED17Q9NVC6 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MED17Q9NVC6 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MED17Q9NVC6 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MED17Q9NVC6 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MED17Q9NVC6 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
MED17Q9NVC6 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MED17Q9NVC6 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
MED17Q9NVC6 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MED17Q9NVC6 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MED17Q9NVC6 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MED17Q9NVC6 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MED17Q9NVC6 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MED17Q9NVC6 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MED17Q9NVC6 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MED17Q9NVC6 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
MED17Q9NVC6 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MED17Q9NVC6 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MED17Q9NVC6 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MED17Q9NVC6 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MED17Q9NVC6 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MED17Q9NVC6 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MED17Q9NVC6 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MED17Q9NVC6 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MED17Q9NVC6 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MED17Q9NVC6 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MED17Q9NVC6 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MED17Q9NVC6 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MED17Q9NVC6 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MED17Q9NVC6 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MED17Q9NVC6 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MED17Q9NVC6 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
MED17Q9NVC6 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MED17Q9NVC6 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MED17Q9NVC6 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MED17Q9NVC6 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MED17Q9NVC6 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MED17Q9NVC6 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MED17Q9NVC6 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MED17Q9NVC6 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MED17Q9NVC6 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MED17Q9NVC6 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MED17Q9NVC6 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MED17Q9NVC6 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MED17Q9NVC6 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MED17Q9NVC6 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MED17Q9NVC6 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MED17Q9NVC6 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MED17Q9NVC6 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MED17Q9NVC6 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MED17Q9NVC6 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MED17Q9NVC6 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MED17Q9NVC6 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
MED17Q9NVC6 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MED17Q9NVC6 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MED17Q9NVC6 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MED17Q9NVC6 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
MED17Q9NVC6 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MED17Q9NVC6 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
MED17Q9NVC6 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MED17Q9NVC6 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MED17Q9NVC6 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MED17Q9NVC6 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MED17Q9NVC6 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MED17Q9NVC6 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MED17Q9NVC6 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MED17Q9NVC6 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MED17Q9NVC6 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MED17Q9NVC6 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MED17Q9NVC6 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MED17Q9NVC6 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MED17Q9NVC6 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MED17Q9NVC6 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms