Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRS6

SNX15, Sorting nexin-15, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX15Q9NRS6 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SNX15Q9NRS6 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SNX15Q9NRS6 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SNX15Q9NRS6 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SNX15Q9NRS6 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SNX15Q9NRS6 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SNX15Q9NRS6 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SNX15Q9NRS6 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SNX15Q9NRS6 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SNX15Q9NRS6 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SNX15Q9NRS6 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SNX15Q9NRS6 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SNX15Q9NRS6 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SNX15Q9NRS6 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SNX15Q9NRS6 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SNX15Q9NRS6 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SNX15Q9NRS6 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SNX15Q9NRS6 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SNX15Q9NRS6 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SNX15Q9NRS6 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SNX15Q9NRS6 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SNX15Q9NRS6 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SNX15Q9NRS6 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SNX15Q9NRS6 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SNX15Q9NRS6 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SNX15Q9NRS6 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
SNX15Q9NRS6 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
SNX15Q9NRS6 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
SNX15Q9NRS6 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SNX15Q9NRS6 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SNX15Q9NRS6 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SNX15Q9NRS6 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SNX15Q9NRS6 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SNX15Q9NRS6 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SNX15Q9NRS6 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SNX15Q9NRS6 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SNX15Q9NRS6 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SNX15Q9NRS6 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SNX15Q9NRS6 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SNX15Q9NRS6 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SNX15Q9NRS6 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SNX15Q9NRS6 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SNX15Q9NRS6 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SNX15Q9NRS6 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SNX15Q9NRS6 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SNX15Q9NRS6 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SNX15Q9NRS6 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SNX15Q9NRS6 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SNX15Q9NRS6 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SNX15Q9NRS6 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SNX15Q9NRS6 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SNX15Q9NRS6 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SNX15Q9NRS6 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SNX15Q9NRS6 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SNX15Q9NRS6 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SNX15Q9NRS6 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SNX15Q9NRS6 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SNX15Q9NRS6 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SNX15Q9NRS6 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SNX15Q9NRS6 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SNX15Q9NRS6 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SNX15Q9NRS6 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNX15Q9NRS6 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNX15Q9NRS6 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNX15Q9NRS6 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNX15Q9NRS6 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNX15Q9NRS6 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNX15Q9NRS6 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNX15Q9NRS6 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNX15Q9NRS6 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNX15Q9NRS6 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNX15Q9NRS6 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNX15Q9NRS6 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNX15Q9NRS6 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNX15Q9NRS6 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNX15Q9NRS6 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNX15Q9NRS6 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SNX15Q9NRS6 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SNX15Q9NRS6 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNX15Q9NRS6 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNX15Q9NRS6 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SNX15Q9NRS6 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SNX15Q9NRS6 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNX15Q9NRS6 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNX15Q9NRS6 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNX15Q9NRS6 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNX15Q9NRS6 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNX15Q9NRS6 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNX15Q9NRS6 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNX15Q9NRS6 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNX15Q9NRS6 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNX15Q9NRS6 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNX15Q9NRS6 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNX15Q9NRS6 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNX15Q9NRS6 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNX15Q9NRS6 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNX15Q9NRS6 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNX15Q9NRS6 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX15Q9NRS6 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX15Q9NRS6 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms