Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ40

SLC52A3, Solute carrier family 52, riboflavin transporter, member 3, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC52A3Q9NQ40 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC52A3Q9NQ40 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC52A3Q9NQ40 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC52A3Q9NQ40 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC52A3Q9NQ40 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC52A3Q9NQ40 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC52A3Q9NQ40 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC52A3Q9NQ40 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC52A3Q9NQ40 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC52A3Q9NQ40 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC52A3Q9NQ40 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC52A3Q9NQ40 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC52A3Q9NQ40 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC52A3Q9NQ40 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC52A3Q9NQ40 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC52A3Q9NQ40 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC52A3Q9NQ40 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC52A3Q9NQ40 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC52A3Q9NQ40 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC52A3Q9NQ40 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC52A3Q9NQ40 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC52A3Q9NQ40 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC52A3Q9NQ40 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC52A3Q9NQ40 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC52A3Q9NQ40 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC52A3Q9NQ40 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC52A3Q9NQ40 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC52A3Q9NQ40 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC52A3Q9NQ40 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC52A3Q9NQ40 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC52A3Q9NQ40 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC52A3Q9NQ40 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC52A3Q9NQ40 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC52A3Q9NQ40 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC52A3Q9NQ40 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC52A3Q9NQ40 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC52A3Q9NQ40 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC52A3Q9NQ40 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC52A3Q9NQ40 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC52A3Q9NQ40 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC52A3Q9NQ40 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC52A3Q9NQ40 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC52A3Q9NQ40 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC52A3Q9NQ40 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC52A3Q9NQ40 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC52A3Q9NQ40 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC52A3Q9NQ40 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC52A3Q9NQ40 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC52A3Q9NQ40 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC52A3Q9NQ40 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC52A3Q9NQ40 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC52A3Q9NQ40 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC52A3Q9NQ40 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC52A3Q9NQ40 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC52A3Q9NQ40 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC52A3Q9NQ40 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC52A3Q9NQ40 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC52A3Q9NQ40 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC52A3Q9NQ40 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC52A3Q9NQ40 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC52A3Q9NQ40 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC52A3Q9NQ40 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC52A3Q9NQ40 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC52A3Q9NQ40 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC52A3Q9NQ40 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC52A3Q9NQ40 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC52A3Q9NQ40 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC52A3Q9NQ40 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC52A3Q9NQ40 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC52A3Q9NQ40 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC52A3Q9NQ40 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC52A3Q9NQ40 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC52A3Q9NQ40 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC52A3Q9NQ40 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC52A3Q9NQ40 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC52A3Q9NQ40 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC52A3Q9NQ40 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC52A3Q9NQ40 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC52A3Q9NQ40 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC52A3Q9NQ40 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC52A3Q9NQ40 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC52A3Q9NQ40 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC52A3Q9NQ40 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC52A3Q9NQ40 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC52A3Q9NQ40 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC52A3Q9NQ40 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC52A3Q9NQ40 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC52A3Q9NQ40 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC52A3Q9NQ40 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC52A3Q9NQ40 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC52A3Q9NQ40 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC52A3Q9NQ40 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC52A3Q9NQ40 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC52A3Q9NQ40 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC52A3Q9NQ40 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC52A3Q9NQ40 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC52A3Q9NQ40 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC52A3Q9NQ40 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC52A3Q9NQ40 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC52A3Q9NQ40 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms