Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPI8

FANCF, Fanconi anemia group F protein, humanhuman

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Length 374 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCFQ9NPI8 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
FANCFQ9NPI8 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FANCFQ9NPI8 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
FANCFQ9NPI8 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
FANCFQ9NPI8 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FANCFQ9NPI8 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FANCFQ9NPI8 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FANCFQ9NPI8 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FANCFQ9NPI8 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FANCFQ9NPI8 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FANCFQ9NPI8 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FANCFQ9NPI8 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FANCFQ9NPI8 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
FANCFQ9NPI8 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FANCFQ9NPI8 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FANCFQ9NPI8 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FANCFQ9NPI8 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FANCFQ9NPI8 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FANCFQ9NPI8 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FANCFQ9NPI8 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FANCFQ9NPI8 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FANCFQ9NPI8 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FANCFQ9NPI8 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FANCFQ9NPI8 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FANCFQ9NPI8 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FANCFQ9NPI8 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FANCFQ9NPI8 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FANCFQ9NPI8 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FANCFQ9NPI8 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
FANCFQ9NPI8 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FANCFQ9NPI8 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FANCFQ9NPI8 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
FANCFQ9NPI8 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FANCFQ9NPI8 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
FANCFQ9NPI8 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
FANCFQ9NPI8 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FANCFQ9NPI8 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
FANCFQ9NPI8 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FANCFQ9NPI8 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FANCFQ9NPI8 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FANCFQ9NPI8 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FANCFQ9NPI8 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FANCFQ9NPI8 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FANCFQ9NPI8 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FANCFQ9NPI8 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
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FANCFQ9NPI8 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FANCFQ9NPI8 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FANCFQ9NPI8 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
FANCFQ9NPI8 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
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FANCFQ9NPI8 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
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FANCFQ9NPI8 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
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FANCFQ9NPI8 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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FANCFQ9NPI8 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FANCFQ9NPI8 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
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FANCFQ9NPI8 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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FANCFQ9NPI8 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FANCFQ9NPI8 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
FANCFQ9NPI8 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FANCFQ9NPI8 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
FANCFQ9NPI8 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FANCFQ9NPI8 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
FANCFQ9NPI8 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
FANCFQ9NPI8 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FANCFQ9NPI8 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
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