Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPD5

SLCO1B3, Solute carrier organic anion transporter family member 1B3, humanhuman

Predictions only

Length 702 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLCO1B3Q9NPD5 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLCO1B3Q9NPD5 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLCO1B3Q9NPD5 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLCO1B3Q9NPD5 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLCO1B3Q9NPD5 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLCO1B3Q9NPD5 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLCO1B3Q9NPD5 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLCO1B3Q9NPD5 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLCO1B3Q9NPD5 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLCO1B3Q9NPD5 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLCO1B3Q9NPD5 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLCO1B3Q9NPD5 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLCO1B3Q9NPD5 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLCO1B3Q9NPD5 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLCO1B3Q9NPD5 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLCO1B3Q9NPD5 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLCO1B3Q9NPD5 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SLCO1B3Q9NPD5 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLCO1B3Q9NPD5 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLCO1B3Q9NPD5 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SLCO1B3Q9NPD5 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLCO1B3Q9NPD5 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SLCO1B3Q9NPD5 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLCO1B3Q9NPD5 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLCO1B3Q9NPD5 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLCO1B3Q9NPD5 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLCO1B3Q9NPD5 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLCO1B3Q9NPD5 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLCO1B3Q9NPD5 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLCO1B3Q9NPD5 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLCO1B3Q9NPD5 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLCO1B3Q9NPD5 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLCO1B3Q9NPD5 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLCO1B3Q9NPD5 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLCO1B3Q9NPD5 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLCO1B3Q9NPD5 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLCO1B3Q9NPD5 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLCO1B3Q9NPD5 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLCO1B3Q9NPD5 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLCO1B3Q9NPD5 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLCO1B3Q9NPD5 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLCO1B3Q9NPD5 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLCO1B3Q9NPD5 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLCO1B3Q9NPD5 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLCO1B3Q9NPD5 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLCO1B3Q9NPD5 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLCO1B3Q9NPD5 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLCO1B3Q9NPD5 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLCO1B3Q9NPD5 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLCO1B3Q9NPD5 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLCO1B3Q9NPD5 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLCO1B3Q9NPD5 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLCO1B3Q9NPD5 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLCO1B3Q9NPD5 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLCO1B3Q9NPD5 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SLCO1B3Q9NPD5 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLCO1B3Q9NPD5 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLCO1B3Q9NPD5 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLCO1B3Q9NPD5 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLCO1B3Q9NPD5 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLCO1B3Q9NPD5 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLCO1B3Q9NPD5 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLCO1B3Q9NPD5 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLCO1B3Q9NPD5 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLCO1B3Q9NPD5 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLCO1B3Q9NPD5 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLCO1B3Q9NPD5 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLCO1B3Q9NPD5 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLCO1B3Q9NPD5 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLCO1B3Q9NPD5 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLCO1B3Q9NPD5 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLCO1B3Q9NPD5 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLCO1B3Q9NPD5 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLCO1B3Q9NPD5 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLCO1B3Q9NPD5 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLCO1B3Q9NPD5 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLCO1B3Q9NPD5 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLCO1B3Q9NPD5 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLCO1B3Q9NPD5 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLCO1B3Q9NPD5 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLCO1B3Q9NPD5 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLCO1B3Q9NPD5 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLCO1B3Q9NPD5 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLCO1B3Q9NPD5 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLCO1B3Q9NPD5 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLCO1B3Q9NPD5 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLCO1B3Q9NPD5 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLCO1B3Q9NPD5 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SLCO1B3Q9NPD5 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLCO1B3Q9NPD5 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SLCO1B3Q9NPD5 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLCO1B3Q9NPD5 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLCO1B3Q9NPD5 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLCO1B3Q9NPD5 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SLCO1B3Q9NPD5 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SLCO1B3Q9NPD5 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLCO1B3Q9NPD5 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SLCO1B3Q9NPD5 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLCO1B3Q9NPD5 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLCO1B3Q9NPD5 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms