Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP87

POLM, DNA-directed DNA/RNA polymerase mu, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLMQ9NP87 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
POLMQ9NP87 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
POLMQ9NP87 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
POLMQ9NP87 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
POLMQ9NP87 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
POLMQ9NP87 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
POLMQ9NP87 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
POLMQ9NP87 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
POLMQ9NP87 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
POLMQ9NP87 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
POLMQ9NP87 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
POLMQ9NP87 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
POLMQ9NP87 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
POLMQ9NP87 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
POLMQ9NP87 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
POLMQ9NP87 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
POLMQ9NP87 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
POLMQ9NP87 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
POLMQ9NP87 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
POLMQ9NP87 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
POLMQ9NP87 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
POLMQ9NP87 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
POLMQ9NP87 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
POLMQ9NP87 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
POLMQ9NP87 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
POLMQ9NP87 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
POLMQ9NP87 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
POLMQ9NP87 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
POLMQ9NP87 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
POLMQ9NP87 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
POLMQ9NP87 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
POLMQ9NP87 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
POLMQ9NP87 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
POLMQ9NP87 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
POLMQ9NP87 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
POLMQ9NP87 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
POLMQ9NP87 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
POLMQ9NP87 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
POLMQ9NP87 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
POLMQ9NP87 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
POLMQ9NP87 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
POLMQ9NP87 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
POLMQ9NP87 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
POLMQ9NP87 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
POLMQ9NP87 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
POLMQ9NP87 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
POLMQ9NP87 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
POLMQ9NP87 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
POLMQ9NP87 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
POLMQ9NP87 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
POLMQ9NP87 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
POLMQ9NP87 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
POLMQ9NP87 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
POLMQ9NP87 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
POLMQ9NP87 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
POLMQ9NP87 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
POLMQ9NP87 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
POLMQ9NP87 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
POLMQ9NP87 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
POLMQ9NP87 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
POLMQ9NP87 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
POLMQ9NP87 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
POLMQ9NP87 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
POLMQ9NP87 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
POLMQ9NP87 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
POLMQ9NP87 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
POLMQ9NP87 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
POLMQ9NP87 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
POLMQ9NP87 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
POLMQ9NP87 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
POLMQ9NP87 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
POLMQ9NP87 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
POLMQ9NP87 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
POLMQ9NP87 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
POLMQ9NP87 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
POLMQ9NP87 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
POLMQ9NP87 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
POLMQ9NP87 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
POLMQ9NP87 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
POLMQ9NP87 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
POLMQ9NP87 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
POLMQ9NP87 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
POLMQ9NP87 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
POLMQ9NP87 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
POLMQ9NP87 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
POLMQ9NP87 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
POLMQ9NP87 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
POLMQ9NP87 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
POLMQ9NP87 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
POLMQ9NP87 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
POLMQ9NP87 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
POLMQ9NP87 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
POLMQ9NP87 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
POLMQ9NP87 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
POLMQ9NP87 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
POLMQ9NP87 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
POLMQ9NP87 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
POLMQ9NP87 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
POLMQ9NP87 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
POLMQ9NP87 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms