Protein–RNA interactions for Protein: Q9HB63

NTN4, Netrin-4, humanhuman

Predictions only

Length 628 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTN4Q9HB63 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NTN4Q9HB63 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NTN4Q9HB63 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NTN4Q9HB63 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NTN4Q9HB63 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NTN4Q9HB63 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NTN4Q9HB63 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NTN4Q9HB63 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
NTN4Q9HB63 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NTN4Q9HB63 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NTN4Q9HB63 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NTN4Q9HB63 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NTN4Q9HB63 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NTN4Q9HB63 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NTN4Q9HB63 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NTN4Q9HB63 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NTN4Q9HB63 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NTN4Q9HB63 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NTN4Q9HB63 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NTN4Q9HB63 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NTN4Q9HB63 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NTN4Q9HB63 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NTN4Q9HB63 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NTN4Q9HB63 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NTN4Q9HB63 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NTN4Q9HB63 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NTN4Q9HB63 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NTN4Q9HB63 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NTN4Q9HB63 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NTN4Q9HB63 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NTN4Q9HB63 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NTN4Q9HB63 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NTN4Q9HB63 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NTN4Q9HB63 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NTN4Q9HB63 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NTN4Q9HB63 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NTN4Q9HB63 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NTN4Q9HB63 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NTN4Q9HB63 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NTN4Q9HB63 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NTN4Q9HB63 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NTN4Q9HB63 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NTN4Q9HB63 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NTN4Q9HB63 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NTN4Q9HB63 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NTN4Q9HB63 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NTN4Q9HB63 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NTN4Q9HB63 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NTN4Q9HB63 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NTN4Q9HB63 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NTN4Q9HB63 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NTN4Q9HB63 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NTN4Q9HB63 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
NTN4Q9HB63 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NTN4Q9HB63 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NTN4Q9HB63 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NTN4Q9HB63 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NTN4Q9HB63 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NTN4Q9HB63 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NTN4Q9HB63 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NTN4Q9HB63 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NTN4Q9HB63 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NTN4Q9HB63 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NTN4Q9HB63 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NTN4Q9HB63 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NTN4Q9HB63 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NTN4Q9HB63 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NTN4Q9HB63 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NTN4Q9HB63 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NTN4Q9HB63 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NTN4Q9HB63 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
NTN4Q9HB63 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NTN4Q9HB63 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NTN4Q9HB63 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NTN4Q9HB63 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NTN4Q9HB63 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NTN4Q9HB63 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NTN4Q9HB63 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NTN4Q9HB63 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
NTN4Q9HB63 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NTN4Q9HB63 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NTN4Q9HB63 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NTN4Q9HB63 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NTN4Q9HB63 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NTN4Q9HB63 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NTN4Q9HB63 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NTN4Q9HB63 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NTN4Q9HB63 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NTN4Q9HB63 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NTN4Q9HB63 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NTN4Q9HB63 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NTN4Q9HB63 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NTN4Q9HB63 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NTN4Q9HB63 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NTN4Q9HB63 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NTN4Q9HB63 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NTN4Q9HB63 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NTN4Q9HB63 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NTN4Q9HB63 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NTN4Q9HB63 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms