Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAW4

CLSPN, Claspin, humanhuman

Predictions only

Length 1,339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSPNQ9HAW4 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CLSPNQ9HAW4 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CLSPNQ9HAW4 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CLSPNQ9HAW4 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CLSPNQ9HAW4 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CLSPNQ9HAW4 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CLSPNQ9HAW4 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CLSPNQ9HAW4 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CLSPNQ9HAW4 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CLSPNQ9HAW4 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CLSPNQ9HAW4 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CLSPNQ9HAW4 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CLSPNQ9HAW4 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CLSPNQ9HAW4 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CLSPNQ9HAW4 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CLSPNQ9HAW4 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CLSPNQ9HAW4 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CLSPNQ9HAW4 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CLSPNQ9HAW4 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CLSPNQ9HAW4 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CLSPNQ9HAW4 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CLSPNQ9HAW4 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CLSPNQ9HAW4 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CLSPNQ9HAW4 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CLSPNQ9HAW4 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CLSPNQ9HAW4 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CLSPNQ9HAW4 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CLSPNQ9HAW4 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CLSPNQ9HAW4 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CLSPNQ9HAW4 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CLSPNQ9HAW4 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CLSPNQ9HAW4 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CLSPNQ9HAW4 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CLSPNQ9HAW4 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CLSPNQ9HAW4 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CLSPNQ9HAW4 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CLSPNQ9HAW4 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CLSPNQ9HAW4 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CLSPNQ9HAW4 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CLSPNQ9HAW4 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CLSPNQ9HAW4 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CLSPNQ9HAW4 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CLSPNQ9HAW4 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CLSPNQ9HAW4 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CLSPNQ9HAW4 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CLSPNQ9HAW4 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CLSPNQ9HAW4 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CLSPNQ9HAW4 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CLSPNQ9HAW4 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CLSPNQ9HAW4 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CLSPNQ9HAW4 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CLSPNQ9HAW4 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CLSPNQ9HAW4 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CLSPNQ9HAW4 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CLSPNQ9HAW4 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CLSPNQ9HAW4 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CLSPNQ9HAW4 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CLSPNQ9HAW4 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CLSPNQ9HAW4 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CLSPNQ9HAW4 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CLSPNQ9HAW4 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CLSPNQ9HAW4 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CLSPNQ9HAW4 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CLSPNQ9HAW4 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CLSPNQ9HAW4 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CLSPNQ9HAW4 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CLSPNQ9HAW4 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CLSPNQ9HAW4 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CLSPNQ9HAW4 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CLSPNQ9HAW4 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CLSPNQ9HAW4 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CLSPNQ9HAW4 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CLSPNQ9HAW4 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CLSPNQ9HAW4 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CLSPNQ9HAW4 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CLSPNQ9HAW4 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CLSPNQ9HAW4 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CLSPNQ9HAW4 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CLSPNQ9HAW4 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CLSPNQ9HAW4 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CLSPNQ9HAW4 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CLSPNQ9HAW4 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CLSPNQ9HAW4 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CLSPNQ9HAW4 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CLSPNQ9HAW4 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CLSPNQ9HAW4 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CLSPNQ9HAW4 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CLSPNQ9HAW4 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CLSPNQ9HAW4 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CLSPNQ9HAW4 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CLSPNQ9HAW4 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CLSPNQ9HAW4 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CLSPNQ9HAW4 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CLSPNQ9HAW4 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CLSPNQ9HAW4 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CLSPNQ9HAW4 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CLSPNQ9HAW4 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CLSPNQ9HAW4 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CLSPNQ9HAW4 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CLSPNQ9HAW4 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms