Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9Z2

LIN28A, Protein lin-28 homolog A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIN28AQ9H9Z2 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LIN28AQ9H9Z2 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LIN28AQ9H9Z2 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LIN28AQ9H9Z2 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LIN28AQ9H9Z2 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LIN28AQ9H9Z2 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LIN28AQ9H9Z2 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LIN28AQ9H9Z2 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
LIN28AQ9H9Z2 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LIN28AQ9H9Z2 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
LIN28AQ9H9Z2 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LIN28AQ9H9Z2 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LIN28AQ9H9Z2 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LIN28AQ9H9Z2 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LIN28AQ9H9Z2 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LIN28AQ9H9Z2 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LIN28AQ9H9Z2 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LIN28AQ9H9Z2 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LIN28AQ9H9Z2 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LIN28AQ9H9Z2 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LIN28AQ9H9Z2 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LIN28AQ9H9Z2 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LIN28AQ9H9Z2 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LIN28AQ9H9Z2 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LIN28AQ9H9Z2 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LIN28AQ9H9Z2 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LIN28AQ9H9Z2 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LIN28AQ9H9Z2 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LIN28AQ9H9Z2 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LIN28AQ9H9Z2 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LIN28AQ9H9Z2 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LIN28AQ9H9Z2 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LIN28AQ9H9Z2 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LIN28AQ9H9Z2 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LIN28AQ9H9Z2 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LIN28AQ9H9Z2 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LIN28AQ9H9Z2 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LIN28AQ9H9Z2 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
LIN28AQ9H9Z2 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LIN28AQ9H9Z2 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LIN28AQ9H9Z2 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LIN28AQ9H9Z2 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LIN28AQ9H9Z2 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LIN28AQ9H9Z2 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LIN28AQ9H9Z2 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LIN28AQ9H9Z2 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LIN28AQ9H9Z2 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LIN28AQ9H9Z2 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
LIN28AQ9H9Z2 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LIN28AQ9H9Z2 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LIN28AQ9H9Z2 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LIN28AQ9H9Z2 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LIN28AQ9H9Z2 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LIN28AQ9H9Z2 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LIN28AQ9H9Z2 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LIN28AQ9H9Z2 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LIN28AQ9H9Z2 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LIN28AQ9H9Z2 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LIN28AQ9H9Z2 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LIN28AQ9H9Z2 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LIN28AQ9H9Z2 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LIN28AQ9H9Z2 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LIN28AQ9H9Z2 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LIN28AQ9H9Z2 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LIN28AQ9H9Z2 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LIN28AQ9H9Z2 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LIN28AQ9H9Z2 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LIN28AQ9H9Z2 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LIN28AQ9H9Z2 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LIN28AQ9H9Z2 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LIN28AQ9H9Z2 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LIN28AQ9H9Z2 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LIN28AQ9H9Z2 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LIN28AQ9H9Z2 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LIN28AQ9H9Z2 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LIN28AQ9H9Z2 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LIN28AQ9H9Z2 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LIN28AQ9H9Z2 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LIN28AQ9H9Z2 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LIN28AQ9H9Z2 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
LIN28AQ9H9Z2 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
LIN28AQ9H9Z2 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LIN28AQ9H9Z2 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LIN28AQ9H9Z2 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LIN28AQ9H9Z2 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LIN28AQ9H9Z2 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
LIN28AQ9H9Z2 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LIN28AQ9H9Z2 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LIN28AQ9H9Z2 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LIN28AQ9H9Z2 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LIN28AQ9H9Z2 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LIN28AQ9H9Z2 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LIN28AQ9H9Z2 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LIN28AQ9H9Z2 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LIN28AQ9H9Z2 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LIN28AQ9H9Z2 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LIN28AQ9H9Z2 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LIN28AQ9H9Z2 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LIN28AQ9H9Z2 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
LIN28AQ9H9Z2 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms