Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0H6

KLHL4, Kelch-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL4Q9C0H6 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHL4Q9C0H6 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHL4Q9C0H6 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHL4Q9C0H6 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHL4Q9C0H6 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHL4Q9C0H6 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHL4Q9C0H6 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHL4Q9C0H6 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHL4Q9C0H6 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHL4Q9C0H6 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHL4Q9C0H6 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHL4Q9C0H6 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHL4Q9C0H6 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHL4Q9C0H6 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHL4Q9C0H6 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHL4Q9C0H6 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHL4Q9C0H6 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHL4Q9C0H6 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHL4Q9C0H6 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHL4Q9C0H6 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHL4Q9C0H6 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHL4Q9C0H6 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHL4Q9C0H6 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHL4Q9C0H6 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHL4Q9C0H6 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHL4Q9C0H6 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHL4Q9C0H6 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHL4Q9C0H6 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHL4Q9C0H6 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHL4Q9C0H6 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHL4Q9C0H6 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KLHL4Q9C0H6 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
KLHL4Q9C0H6 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KLHL4Q9C0H6 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
KLHL4Q9C0H6 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC16■□□□□ 0.15
KLHL4Q9C0H6 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC16■□□□□ 0.15
KLHL4Q9C0H6 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC16■□□□□ 0.15
KLHL4Q9C0H6 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
KLHL4Q9C0H6 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
KLHL4Q9C0H6 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
KLHL4Q9C0H6 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KLHL4Q9C0H6 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KLHL4Q9C0H6 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
KLHL4Q9C0H6 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KLHL4Q9C0H6 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
KLHL4Q9C0H6 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KLHL4Q9C0H6 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KLHL4Q9C0H6 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KLHL4Q9C0H6 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KLHL4Q9C0H6 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KLHL4Q9C0H6 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
KLHL4Q9C0H6 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KLHL4Q9C0H6 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
KLHL4Q9C0H6 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
KLHL4Q9C0H6 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
KLHL4Q9C0H6 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC16■□□□□ 0.15
KLHL4Q9C0H6 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC16■□□□□ 0.15
KLHL4Q9C0H6 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
KLHL4Q9C0H6 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KLHL4Q9C0H6 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KLHL4Q9C0H6 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KLHL4Q9C0H6 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KLHL4Q9C0H6 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KLHL4Q9C0H6 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC16■□□□□ 0.15
KLHL4Q9C0H6 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KLHL4Q9C0H6 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
KLHL4Q9C0H6 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KLHL4Q9C0H6 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KLHL4Q9C0H6 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KLHL4Q9C0H6 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KLHL4Q9C0H6 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KLHL4Q9C0H6 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
KLHL4Q9C0H6 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHL4Q9C0H6 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHL4Q9C0H6 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHL4Q9C0H6 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHL4Q9C0H6 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHL4Q9C0H6 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHL4Q9C0H6 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHL4Q9C0H6 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHL4Q9C0H6 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHL4Q9C0H6 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHL4Q9C0H6 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHL4Q9C0H6 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHL4Q9C0H6 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHL4Q9C0H6 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHL4Q9C0H6 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHL4Q9C0H6 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHL4Q9C0H6 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHL4Q9C0H6 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHL4Q9C0H6 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHL4Q9C0H6 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHL4Q9C0H6 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHL4Q9C0H6 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHL4Q9C0H6 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHL4Q9C0H6 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHL4Q9C0H6 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHL4Q9C0H6 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHL4Q9C0H6 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHL4Q9C0H6 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms