Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY07

SLC4A5, Electrogenic sodium bicarbonate cotransporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A5Q9BY07 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SLC4A5Q9BY07 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SLC4A5Q9BY07 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
SLC4A5Q9BY07 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SLC4A5Q9BY07 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SLC4A5Q9BY07 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SLC4A5Q9BY07 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SLC4A5Q9BY07 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SLC4A5Q9BY07 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SLC4A5Q9BY07 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SLC4A5Q9BY07 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SLC4A5Q9BY07 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SLC4A5Q9BY07 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SLC4A5Q9BY07 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SLC4A5Q9BY07 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SLC4A5Q9BY07 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SLC4A5Q9BY07 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SLC4A5Q9BY07 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SLC4A5Q9BY07 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SLC4A5Q9BY07 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SLC4A5Q9BY07 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SLC4A5Q9BY07 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SLC4A5Q9BY07 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SLC4A5Q9BY07 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SLC4A5Q9BY07 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SLC4A5Q9BY07 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SLC4A5Q9BY07 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SLC4A5Q9BY07 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
SLC4A5Q9BY07 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SLC4A5Q9BY07 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SLC4A5Q9BY07 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
SLC4A5Q9BY07 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
SLC4A5Q9BY07 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SLC4A5Q9BY07 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SLC4A5Q9BY07 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
SLC4A5Q9BY07 BX547991.1-201ENST00000582543 1206 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SLC4A5Q9BY07 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SLC4A5Q9BY07 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SLC4A5Q9BY07 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
SLC4A5Q9BY07 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
SLC4A5Q9BY07 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SLC4A5Q9BY07 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
SLC4A5Q9BY07 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
SLC4A5Q9BY07 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
SLC4A5Q9BY07 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SLC4A5Q9BY07 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SLC4A5Q9BY07 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SLC4A5Q9BY07 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SLC4A5Q9BY07 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SLC4A5Q9BY07 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SLC4A5Q9BY07 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC4A5Q9BY07 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC4A5Q9BY07 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC4A5Q9BY07 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC4A5Q9BY07 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC4A5Q9BY07 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC4A5Q9BY07 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC4A5Q9BY07 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC4A5Q9BY07 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC4A5Q9BY07 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC4A5Q9BY07 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC4A5Q9BY07 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC4A5Q9BY07 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC4A5Q9BY07 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC4A5Q9BY07 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC4A5Q9BY07 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC4A5Q9BY07 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC4A5Q9BY07 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC4A5Q9BY07 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC4A5Q9BY07 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC4A5Q9BY07 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC4A5Q9BY07 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC4A5Q9BY07 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC4A5Q9BY07 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC4A5Q9BY07 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC4A5Q9BY07 AC132872.1-201ENST00000566986 1195 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC4A5Q9BY07 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC4A5Q9BY07 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC4A5Q9BY07 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC4A5Q9BY07 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC4A5Q9BY07 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC4A5Q9BY07 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC4A5Q9BY07 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC4A5Q9BY07 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC4A5Q9BY07 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC4A5Q9BY07 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC4A5Q9BY07 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC4A5Q9BY07 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC4A5Q9BY07 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC4A5Q9BY07 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC4A5Q9BY07 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC4A5Q9BY07 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC4A5Q9BY07 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC4A5Q9BY07 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC4A5Q9BY07 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC4A5Q9BY07 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC4A5Q9BY07 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC4A5Q9BY07 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC4A5Q9BY07 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC4A5Q9BY07 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms