Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXF6

RAB11FIP5, Rab11 family-interacting protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 653 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP5Q9BXF6 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB11FIP5Q9BXF6 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB11FIP5Q9BXF6 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB11FIP5Q9BXF6 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB11FIP5Q9BXF6 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB11FIP5Q9BXF6 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB11FIP5Q9BXF6 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB11FIP5Q9BXF6 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB11FIP5Q9BXF6 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB11FIP5Q9BXF6 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB11FIP5Q9BXF6 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB11FIP5Q9BXF6 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB11FIP5Q9BXF6 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB11FIP5Q9BXF6 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB11FIP5Q9BXF6 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB11FIP5Q9BXF6 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB11FIP5Q9BXF6 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB11FIP5Q9BXF6 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB11FIP5Q9BXF6 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB11FIP5Q9BXF6 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB11FIP5Q9BXF6 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB11FIP5Q9BXF6 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB11FIP5Q9BXF6 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB11FIP5Q9BXF6 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB11FIP5Q9BXF6 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB11FIP5Q9BXF6 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB11FIP5Q9BXF6 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB11FIP5Q9BXF6 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB11FIP5Q9BXF6 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB11FIP5Q9BXF6 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB11FIP5Q9BXF6 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB11FIP5Q9BXF6 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB11FIP5Q9BXF6 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB11FIP5Q9BXF6 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB11FIP5Q9BXF6 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB11FIP5Q9BXF6 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB11FIP5Q9BXF6 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB11FIP5Q9BXF6 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB11FIP5Q9BXF6 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB11FIP5Q9BXF6 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB11FIP5Q9BXF6 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB11FIP5Q9BXF6 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB11FIP5Q9BXF6 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB11FIP5Q9BXF6 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB11FIP5Q9BXF6 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB11FIP5Q9BXF6 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB11FIP5Q9BXF6 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB11FIP5Q9BXF6 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB11FIP5Q9BXF6 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB11FIP5Q9BXF6 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB11FIP5Q9BXF6 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB11FIP5Q9BXF6 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB11FIP5Q9BXF6 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB11FIP5Q9BXF6 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB11FIP5Q9BXF6 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB11FIP5Q9BXF6 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB11FIP5Q9BXF6 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB11FIP5Q9BXF6 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB11FIP5Q9BXF6 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB11FIP5Q9BXF6 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB11FIP5Q9BXF6 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB11FIP5Q9BXF6 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB11FIP5Q9BXF6 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB11FIP5Q9BXF6 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB11FIP5Q9BXF6 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB11FIP5Q9BXF6 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB11FIP5Q9BXF6 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB11FIP5Q9BXF6 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB11FIP5Q9BXF6 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB11FIP5Q9BXF6 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB11FIP5Q9BXF6 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB11FIP5Q9BXF6 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB11FIP5Q9BXF6 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB11FIP5Q9BXF6 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB11FIP5Q9BXF6 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB11FIP5Q9BXF6 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB11FIP5Q9BXF6 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB11FIP5Q9BXF6 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB11FIP5Q9BXF6 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB11FIP5Q9BXF6 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB11FIP5Q9BXF6 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB11FIP5Q9BXF6 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB11FIP5Q9BXF6 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB11FIP5Q9BXF6 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB11FIP5Q9BXF6 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB11FIP5Q9BXF6 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB11FIP5Q9BXF6 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB11FIP5Q9BXF6 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB11FIP5Q9BXF6 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB11FIP5Q9BXF6 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB11FIP5Q9BXF6 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB11FIP5Q9BXF6 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB11FIP5Q9BXF6 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB11FIP5Q9BXF6 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB11FIP5Q9BXF6 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB11FIP5Q9BXF6 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB11FIP5Q9BXF6 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB11FIP5Q9BXF6 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB11FIP5Q9BXF6 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB11FIP5Q9BXF6 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms