Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQK8

LPIN3, Phosphatidate phosphatase LPIN3, humanhuman

Predictions only

Length 851 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LPIN3Q9BQK8 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
LPIN3Q9BQK8 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
LPIN3Q9BQK8 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
LPIN3Q9BQK8 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
LPIN3Q9BQK8 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LPIN3Q9BQK8 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
LPIN3Q9BQK8 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LPIN3Q9BQK8 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LPIN3Q9BQK8 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LPIN3Q9BQK8 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LPIN3Q9BQK8 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LPIN3Q9BQK8 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
LPIN3Q9BQK8 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LPIN3Q9BQK8 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
LPIN3Q9BQK8 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LPIN3Q9BQK8 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LPIN3Q9BQK8 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
LPIN3Q9BQK8 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LPIN3Q9BQK8 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LPIN3Q9BQK8 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
LPIN3Q9BQK8 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
LPIN3Q9BQK8 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
LPIN3Q9BQK8 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LPIN3Q9BQK8 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
LPIN3Q9BQK8 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LPIN3Q9BQK8 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
LPIN3Q9BQK8 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
LPIN3Q9BQK8 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
LPIN3Q9BQK8 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LPIN3Q9BQK8 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LPIN3Q9BQK8 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LPIN3Q9BQK8 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LPIN3Q9BQK8 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
LPIN3Q9BQK8 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LPIN3Q9BQK8 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
LPIN3Q9BQK8 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
LPIN3Q9BQK8 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
LPIN3Q9BQK8 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
LPIN3Q9BQK8 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LPIN3Q9BQK8 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LPIN3Q9BQK8 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
LPIN3Q9BQK8 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
LPIN3Q9BQK8 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
LPIN3Q9BQK8 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
LPIN3Q9BQK8 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
LPIN3Q9BQK8 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
LPIN3Q9BQK8 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LPIN3Q9BQK8 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
LPIN3Q9BQK8 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
LPIN3Q9BQK8 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
LPIN3Q9BQK8 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LPIN3Q9BQK8 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
LPIN3Q9BQK8 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LPIN3Q9BQK8 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LPIN3Q9BQK8 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LPIN3Q9BQK8 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LPIN3Q9BQK8 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
LPIN3Q9BQK8 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LPIN3Q9BQK8 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LPIN3Q9BQK8 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
LPIN3Q9BQK8 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LPIN3Q9BQK8 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LPIN3Q9BQK8 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
LPIN3Q9BQK8 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
LPIN3Q9BQK8 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LPIN3Q9BQK8 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LPIN3Q9BQK8 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
LPIN3Q9BQK8 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LPIN3Q9BQK8 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LPIN3Q9BQK8 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LPIN3Q9BQK8 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LPIN3Q9BQK8 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LPIN3Q9BQK8 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LPIN3Q9BQK8 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LPIN3Q9BQK8 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LPIN3Q9BQK8 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LPIN3Q9BQK8 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LPIN3Q9BQK8 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LPIN3Q9BQK8 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LPIN3Q9BQK8 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LPIN3Q9BQK8 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LPIN3Q9BQK8 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LPIN3Q9BQK8 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LPIN3Q9BQK8 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LPIN3Q9BQK8 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LPIN3Q9BQK8 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LPIN3Q9BQK8 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LPIN3Q9BQK8 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LPIN3Q9BQK8 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LPIN3Q9BQK8 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LPIN3Q9BQK8 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LPIN3Q9BQK8 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LPIN3Q9BQK8 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LPIN3Q9BQK8 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
LPIN3Q9BQK8 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LPIN3Q9BQK8 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LPIN3Q9BQK8 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
LPIN3Q9BQK8 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LPIN3Q9BQK8 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LPIN3Q9BQK8 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms