Protein–RNA interactions for Protein: Q99627

COPS8, COP9 signalosome complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS8Q99627 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
COPS8Q99627 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
COPS8Q99627 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
COPS8Q99627 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
COPS8Q99627 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
COPS8Q99627 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
COPS8Q99627 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
COPS8Q99627 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
COPS8Q99627 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
COPS8Q99627 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
COPS8Q99627 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
COPS8Q99627 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
COPS8Q99627 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
COPS8Q99627 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
COPS8Q99627 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
COPS8Q99627 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
COPS8Q99627 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
COPS8Q99627 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
COPS8Q99627 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
COPS8Q99627 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
COPS8Q99627 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
COPS8Q99627 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
COPS8Q99627 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
COPS8Q99627 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
COPS8Q99627 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
COPS8Q99627 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
COPS8Q99627 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
COPS8Q99627 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
COPS8Q99627 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
COPS8Q99627 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
COPS8Q99627 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
COPS8Q99627 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
COPS8Q99627 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
COPS8Q99627 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
COPS8Q99627 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
COPS8Q99627 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
COPS8Q99627 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
COPS8Q99627 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
COPS8Q99627 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
COPS8Q99627 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
COPS8Q99627 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
COPS8Q99627 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
COPS8Q99627 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
COPS8Q99627 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
COPS8Q99627 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
COPS8Q99627 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
COPS8Q99627 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
COPS8Q99627 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
COPS8Q99627 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
COPS8Q99627 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
COPS8Q99627 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
COPS8Q99627 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
COPS8Q99627 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
COPS8Q99627 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
COPS8Q99627 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
COPS8Q99627 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
COPS8Q99627 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
COPS8Q99627 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
COPS8Q99627 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
COPS8Q99627 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
COPS8Q99627 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
COPS8Q99627 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
COPS8Q99627 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
COPS8Q99627 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
COPS8Q99627 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
COPS8Q99627 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
COPS8Q99627 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
COPS8Q99627 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
COPS8Q99627 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
COPS8Q99627 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
COPS8Q99627 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
COPS8Q99627 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
COPS8Q99627 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
COPS8Q99627 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
COPS8Q99627 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
COPS8Q99627 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
COPS8Q99627 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
COPS8Q99627 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
COPS8Q99627 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
COPS8Q99627 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
COPS8Q99627 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
COPS8Q99627 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
COPS8Q99627 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
COPS8Q99627 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
COPS8Q99627 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
COPS8Q99627 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
COPS8Q99627 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
COPS8Q99627 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
COPS8Q99627 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
COPS8Q99627 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
COPS8Q99627 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
COPS8Q99627 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
COPS8Q99627 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
COPS8Q99627 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
COPS8Q99627 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
COPS8Q99627 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
COPS8Q99627 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
COPS8Q99627 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
COPS8Q99627 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
COPS8Q99627 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms