Protein–RNA interactions for Protein: Q96RJ3

TNFRSF13C, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 13C, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF13CQ96RJ3 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
TNFRSF13CQ96RJ3 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
TNFRSF13CQ96RJ3 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
TNFRSF13CQ96RJ3 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TNFRSF13CQ96RJ3 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TNFRSF13CQ96RJ3 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TNFRSF13CQ96RJ3 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TNFRSF13CQ96RJ3 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TNFRSF13CQ96RJ3 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TNFRSF13CQ96RJ3 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TNFRSF13CQ96RJ3 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TNFRSF13CQ96RJ3 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TNFRSF13CQ96RJ3 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TNFRSF13CQ96RJ3 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TNFRSF13CQ96RJ3 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TNFRSF13CQ96RJ3 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TNFRSF13CQ96RJ3 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TNFRSF13CQ96RJ3 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TNFRSF13CQ96RJ3 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TNFRSF13CQ96RJ3 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TNFRSF13CQ96RJ3 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TNFRSF13CQ96RJ3 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TNFRSF13CQ96RJ3 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TNFRSF13CQ96RJ3 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TNFRSF13CQ96RJ3 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TNFRSF13CQ96RJ3 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
TNFRSF13CQ96RJ3 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TNFRSF13CQ96RJ3 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC15.05■□□□□ 0
TNFRSF13CQ96RJ3 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TNFRSF13CQ96RJ3 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TNFRSF13CQ96RJ3 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TNFRSF13CQ96RJ3 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
TNFRSF13CQ96RJ3 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TNFRSF13CQ96RJ3 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TNFRSF13CQ96RJ3 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TNFRSF13CQ96RJ3 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TNFRSF13CQ96RJ3 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TNFRSF13CQ96RJ3 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TNFRSF13CQ96RJ3 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TNFRSF13CQ96RJ3 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TNFRSF13CQ96RJ3 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
TNFRSF13CQ96RJ3 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TNFRSF13CQ96RJ3 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TNFRSF13CQ96RJ3 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC15.05■□□□□ -0
TNFRSF13CQ96RJ3 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TNFRSF13CQ96RJ3 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC15.05■□□□□ -0
TNFRSF13CQ96RJ3 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TNFRSF13CQ96RJ3 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
TNFRSF13CQ96RJ3 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC15.05■□□□□ -0
TNFRSF13CQ96RJ3 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TNFRSF13CQ96RJ3 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TNFRSF13CQ96RJ3 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TNFRSF13CQ96RJ3 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TNFRSF13CQ96RJ3 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TNFRSF13CQ96RJ3 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
TNFRSF13CQ96RJ3 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TNFRSF13CQ96RJ3 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TNFRSF13CQ96RJ3 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC15.05■□□□□ -0
TNFRSF13CQ96RJ3 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TNFRSF13CQ96RJ3 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TNFRSF13CQ96RJ3 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TNFRSF13CQ96RJ3 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TNFRSF13CQ96RJ3 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TNFRSF13CQ96RJ3 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TNFRSF13CQ96RJ3 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TNFRSF13CQ96RJ3 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TNFRSF13CQ96RJ3 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TNFRSF13CQ96RJ3 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TNFRSF13CQ96RJ3 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TNFRSF13CQ96RJ3 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TNFRSF13CQ96RJ3 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TNFRSF13CQ96RJ3 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TNFRSF13CQ96RJ3 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TNFRSF13CQ96RJ3 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TNFRSF13CQ96RJ3 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TNFRSF13CQ96RJ3 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TNFRSF13CQ96RJ3 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TNFRSF13CQ96RJ3 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TNFRSF13CQ96RJ3 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TNFRSF13CQ96RJ3 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TNFRSF13CQ96RJ3 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TNFRSF13CQ96RJ3 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TNFRSF13CQ96RJ3 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TNFRSF13CQ96RJ3 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TNFRSF13CQ96RJ3 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TNFRSF13CQ96RJ3 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TNFRSF13CQ96RJ3 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TNFRSF13CQ96RJ3 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TNFRSF13CQ96RJ3 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TNFRSF13CQ96RJ3 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TNFRSF13CQ96RJ3 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
TNFRSF13CQ96RJ3 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TNFRSF13CQ96RJ3 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TNFRSF13CQ96RJ3 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TNFRSF13CQ96RJ3 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TNFRSF13CQ96RJ3 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TNFRSF13CQ96RJ3 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TNFRSF13CQ96RJ3 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TNFRSF13CQ96RJ3 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TNFRSF13CQ96RJ3 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 119.4 ms