Protein–RNA interactions for Protein: Q96QD8

SLC38A2, Sodium-coupled neutral amino acid transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC38A2Q96QD8 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC38A2Q96QD8 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC38A2Q96QD8 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC38A2Q96QD8 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC38A2Q96QD8 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC38A2Q96QD8 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC38A2Q96QD8 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC38A2Q96QD8 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC38A2Q96QD8 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC38A2Q96QD8 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC38A2Q96QD8 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC38A2Q96QD8 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC38A2Q96QD8 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC38A2Q96QD8 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC38A2Q96QD8 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC38A2Q96QD8 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC38A2Q96QD8 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC38A2Q96QD8 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC38A2Q96QD8 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC38A2Q96QD8 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC38A2Q96QD8 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC38A2Q96QD8 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC38A2Q96QD8 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC38A2Q96QD8 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC38A2Q96QD8 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC38A2Q96QD8 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC38A2Q96QD8 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC38A2Q96QD8 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC38A2Q96QD8 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC38A2Q96QD8 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC38A2Q96QD8 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC38A2Q96QD8 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC38A2Q96QD8 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC38A2Q96QD8 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC38A2Q96QD8 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC38A2Q96QD8 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC38A2Q96QD8 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SLC38A2Q96QD8 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SLC38A2Q96QD8 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SLC38A2Q96QD8 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SLC38A2Q96QD8 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SLC38A2Q96QD8 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SLC38A2Q96QD8 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SLC38A2Q96QD8 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SLC38A2Q96QD8 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SLC38A2Q96QD8 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SLC38A2Q96QD8 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SLC38A2Q96QD8 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SLC38A2Q96QD8 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SLC38A2Q96QD8 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SLC38A2Q96QD8 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SLC38A2Q96QD8 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SLC38A2Q96QD8 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SLC38A2Q96QD8 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SLC38A2Q96QD8 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SLC38A2Q96QD8 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SLC38A2Q96QD8 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SLC38A2Q96QD8 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SLC38A2Q96QD8 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
SLC38A2Q96QD8 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
SLC38A2Q96QD8 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SLC38A2Q96QD8 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SLC38A2Q96QD8 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SLC38A2Q96QD8 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SLC38A2Q96QD8 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SLC38A2Q96QD8 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SLC38A2Q96QD8 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SLC38A2Q96QD8 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
SLC38A2Q96QD8 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SLC38A2Q96QD8 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SLC38A2Q96QD8 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SLC38A2Q96QD8 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SLC38A2Q96QD8 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SLC38A2Q96QD8 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SLC38A2Q96QD8 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SLC38A2Q96QD8 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SLC38A2Q96QD8 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SLC38A2Q96QD8 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SLC38A2Q96QD8 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
SLC38A2Q96QD8 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
SLC38A2Q96QD8 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SLC38A2Q96QD8 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SLC38A2Q96QD8 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SLC38A2Q96QD8 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SLC38A2Q96QD8 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SLC38A2Q96QD8 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SLC38A2Q96QD8 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SLC38A2Q96QD8 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SLC38A2Q96QD8 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SLC38A2Q96QD8 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SLC38A2Q96QD8 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SLC38A2Q96QD8 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SLC38A2Q96QD8 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SLC38A2Q96QD8 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SLC38A2Q96QD8 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SLC38A2Q96QD8 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SLC38A2Q96QD8 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SLC38A2Q96QD8 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SLC38A2Q96QD8 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SLC38A2Q96QD8 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.1 ms