Protein–RNA interactions for Protein: Q96M20

CNBD2, Cyclic nucleotide-binding domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 576 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNBD2Q96M20 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CNBD2Q96M20 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNBD2Q96M20 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CNBD2Q96M20 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNBD2Q96M20 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNBD2Q96M20 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CNBD2Q96M20 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNBD2Q96M20 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNBD2Q96M20 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNBD2Q96M20 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNBD2Q96M20 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNBD2Q96M20 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNBD2Q96M20 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNBD2Q96M20 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNBD2Q96M20 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNBD2Q96M20 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNBD2Q96M20 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNBD2Q96M20 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNBD2Q96M20 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNBD2Q96M20 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNBD2Q96M20 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNBD2Q96M20 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNBD2Q96M20 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNBD2Q96M20 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNBD2Q96M20 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNBD2Q96M20 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNBD2Q96M20 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNBD2Q96M20 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNBD2Q96M20 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNBD2Q96M20 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNBD2Q96M20 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNBD2Q96M20 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNBD2Q96M20 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNBD2Q96M20 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNBD2Q96M20 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNBD2Q96M20 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNBD2Q96M20 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNBD2Q96M20 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNBD2Q96M20 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNBD2Q96M20 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNBD2Q96M20 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNBD2Q96M20 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNBD2Q96M20 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNBD2Q96M20 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CNBD2Q96M20 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CNBD2Q96M20 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNBD2Q96M20 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNBD2Q96M20 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNBD2Q96M20 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CNBD2Q96M20 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNBD2Q96M20 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNBD2Q96M20 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CNBD2Q96M20 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNBD2Q96M20 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNBD2Q96M20 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNBD2Q96M20 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNBD2Q96M20 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNBD2Q96M20 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNBD2Q96M20 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNBD2Q96M20 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNBD2Q96M20 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNBD2Q96M20 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNBD2Q96M20 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNBD2Q96M20 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNBD2Q96M20 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CNBD2Q96M20 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CNBD2Q96M20 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CNBD2Q96M20 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CNBD2Q96M20 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CNBD2Q96M20 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CNBD2Q96M20 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CNBD2Q96M20 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CNBD2Q96M20 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CNBD2Q96M20 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CNBD2Q96M20 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CNBD2Q96M20 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CNBD2Q96M20 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CNBD2Q96M20 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CNBD2Q96M20 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CNBD2Q96M20 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CNBD2Q96M20 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CNBD2Q96M20 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CNBD2Q96M20 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CNBD2Q96M20 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CNBD2Q96M20 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CNBD2Q96M20 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CNBD2Q96M20 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CNBD2Q96M20 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CNBD2Q96M20 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CNBD2Q96M20 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CNBD2Q96M20 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CNBD2Q96M20 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CNBD2Q96M20 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CNBD2Q96M20 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CNBD2Q96M20 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CNBD2Q96M20 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CNBD2Q96M20 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CNBD2Q96M20 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CNBD2Q96M20 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CNBD2Q96M20 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 246.7 ms