Protein–RNA interactions for Protein: Q96KT6

LINC00208, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00208, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00208Q96KT6 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
LINC00208Q96KT6 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC9.4□□□□□ -0.9
LINC00208Q96KT6 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
LINC00208Q96KT6 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
LINC00208Q96KT6 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC9.4□□□□□ -0.9
LINC00208Q96KT6 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
LINC00208Q96KT6 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.9
LINC00208Q96KT6 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
LINC00208Q96KT6 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
LINC00208Q96KT6 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
LINC00208Q96KT6 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.9
LINC00208Q96KT6 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC9.4□□□□□ -0.9
LINC00208Q96KT6 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.9
LINC00208Q96KT6 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.9
LINC00208Q96KT6 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
LINC00208Q96KT6 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.9
LINC00208Q96KT6 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.9
LINC00208Q96KT6 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.9
LINC00208Q96KT6 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
LINC00208Q96KT6 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
LINC00208Q96KT6 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.9
LINC00208Q96KT6 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
LINC00208Q96KT6 PIK3CG-205ENST00000496166 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
LINC00208Q96KT6 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC9.4□□□□□ -0.9
LINC00208Q96KT6 COLGALT1-201ENST00000252599 3704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
LINC00208Q96KT6 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
LINC00208Q96KT6 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
LINC00208Q96KT6 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC9.4□□□□□ -0.9
LINC00208Q96KT6 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
LINC00208Q96KT6 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.9
LINC00208Q96KT6 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
LINC00208Q96KT6 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC9.4□□□□□ -0.9
LINC00208Q96KT6 CD6-201ENST00000313421 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
LINC00208Q96KT6 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
LINC00208Q96KT6 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
LINC00208Q96KT6 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC9.4□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC9.4□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC9.4□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 FUT1-201ENST00000310160 4246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 ARPIN-201ENST00000357484 7591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 RERE-201ENST00000337907 8026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC9.4□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.39□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC9.39□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 WDFY1-201ENST00000233055 4660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 ARID4A-202ENST00000355431 5891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 PPP1R15B-201ENST00000367188 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC9.39□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 BMT2-201ENST00000297145 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 CGB7-203ENST00000597853 3386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.39□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.39□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 NTN4-201ENST00000343702 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 TLR6-202ENST00000436693 5880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 FAM168B-202ENST00000409185 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC9.39□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC9.39□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.39□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC9.39□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC9.39□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC9.39□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 ANKRD30B-202ENST00000358984 4359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 MEFV-201ENST00000219596 3499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.2 ms