Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB5

CDK5RAP3, CDK5 regulatory subunit-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5RAP3Q96JB5 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CDK5RAP3Q96JB5 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CDK5RAP3Q96JB5 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CDK5RAP3Q96JB5 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CDK5RAP3Q96JB5 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CDK5RAP3Q96JB5 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
CDK5RAP3Q96JB5 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CDK5RAP3Q96JB5 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CDK5RAP3Q96JB5 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CDK5RAP3Q96JB5 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CDK5RAP3Q96JB5 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CDK5RAP3Q96JB5 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CDK5RAP3Q96JB5 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CDK5RAP3Q96JB5 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CDK5RAP3Q96JB5 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CDK5RAP3Q96JB5 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CDK5RAP3Q96JB5 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CDK5RAP3Q96JB5 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CDK5RAP3Q96JB5 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
CDK5RAP3Q96JB5 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
CDK5RAP3Q96JB5 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC18.64■□□□□ 0.58
CDK5RAP3Q96JB5 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
CDK5RAP3Q96JB5 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
CDK5RAP3Q96JB5 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CDK5RAP3Q96JB5 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CDK5RAP3Q96JB5 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CDK5RAP3Q96JB5 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CDK5RAP3Q96JB5 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CDK5RAP3Q96JB5 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CDK5RAP3Q96JB5 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CDK5RAP3Q96JB5 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CDK5RAP3Q96JB5 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CDK5RAP3Q96JB5 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
CDK5RAP3Q96JB5 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CDK5RAP3Q96JB5 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CDK5RAP3Q96JB5 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
CDK5RAP3Q96JB5 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CDK5RAP3Q96JB5 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CDK5RAP3Q96JB5 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
CDK5RAP3Q96JB5 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CDK5RAP3Q96JB5 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
CDK5RAP3Q96JB5 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CDK5RAP3Q96JB5 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CDK5RAP3Q96JB5 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CDK5RAP3Q96JB5 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CDK5RAP3Q96JB5 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CDK5RAP3Q96JB5 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CDK5RAP3Q96JB5 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CDK5RAP3Q96JB5 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CDK5RAP3Q96JB5 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CDK5RAP3Q96JB5 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CDK5RAP3Q96JB5 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CDK5RAP3Q96JB5 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CDK5RAP3Q96JB5 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CDK5RAP3Q96JB5 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CDK5RAP3Q96JB5 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CDK5RAP3Q96JB5 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CDK5RAP3Q96JB5 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CDK5RAP3Q96JB5 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CDK5RAP3Q96JB5 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CDK5RAP3Q96JB5 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CDK5RAP3Q96JB5 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CDK5RAP3Q96JB5 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CDK5RAP3Q96JB5 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CDK5RAP3Q96JB5 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CDK5RAP3Q96JB5 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CDK5RAP3Q96JB5 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CDK5RAP3Q96JB5 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CDK5RAP3Q96JB5 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CDK5RAP3Q96JB5 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CDK5RAP3Q96JB5 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CDK5RAP3Q96JB5 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CDK5RAP3Q96JB5 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CDK5RAP3Q96JB5 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CDK5RAP3Q96JB5 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CDK5RAP3Q96JB5 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CDK5RAP3Q96JB5 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CDK5RAP3Q96JB5 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CDK5RAP3Q96JB5 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CDK5RAP3Q96JB5 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CDK5RAP3Q96JB5 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CDK5RAP3Q96JB5 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
CDK5RAP3Q96JB5 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CDK5RAP3Q96JB5 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CDK5RAP3Q96JB5 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CDK5RAP3Q96JB5 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
CDK5RAP3Q96JB5 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CDK5RAP3Q96JB5 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CDK5RAP3Q96JB5 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
CDK5RAP3Q96JB5 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CDK5RAP3Q96JB5 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CDK5RAP3Q96JB5 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CDK5RAP3Q96JB5 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CDK5RAP3Q96JB5 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CDK5RAP3Q96JB5 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CDK5RAP3Q96JB5 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CDK5RAP3Q96JB5 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CDK5RAP3Q96JB5 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CDK5RAP3Q96JB5 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CDK5RAP3Q96JB5 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.9 ms