Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB2

COG3, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG3Q96JB2 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
COG3Q96JB2 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
COG3Q96JB2 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
COG3Q96JB2 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
COG3Q96JB2 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
COG3Q96JB2 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
COG3Q96JB2 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
COG3Q96JB2 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
COG3Q96JB2 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
COG3Q96JB2 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
COG3Q96JB2 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
COG3Q96JB2 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
COG3Q96JB2 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
COG3Q96JB2 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
COG3Q96JB2 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
COG3Q96JB2 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
COG3Q96JB2 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
COG3Q96JB2 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
COG3Q96JB2 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
COG3Q96JB2 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
COG3Q96JB2 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
COG3Q96JB2 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
COG3Q96JB2 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
COG3Q96JB2 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
COG3Q96JB2 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
COG3Q96JB2 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
COG3Q96JB2 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
COG3Q96JB2 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
COG3Q96JB2 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
COG3Q96JB2 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
COG3Q96JB2 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
COG3Q96JB2 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
COG3Q96JB2 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
COG3Q96JB2 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
COG3Q96JB2 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
COG3Q96JB2 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
COG3Q96JB2 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
COG3Q96JB2 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
COG3Q96JB2 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
COG3Q96JB2 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
COG3Q96JB2 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
COG3Q96JB2 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
COG3Q96JB2 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
COG3Q96JB2 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
COG3Q96JB2 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
COG3Q96JB2 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
COG3Q96JB2 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
COG3Q96JB2 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
COG3Q96JB2 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
COG3Q96JB2 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
COG3Q96JB2 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
COG3Q96JB2 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
COG3Q96JB2 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
COG3Q96JB2 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
COG3Q96JB2 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
COG3Q96JB2 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
COG3Q96JB2 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
COG3Q96JB2 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
COG3Q96JB2 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
COG3Q96JB2 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
COG3Q96JB2 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
COG3Q96JB2 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
COG3Q96JB2 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
COG3Q96JB2 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
COG3Q96JB2 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
COG3Q96JB2 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
COG3Q96JB2 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
COG3Q96JB2 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
COG3Q96JB2 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
COG3Q96JB2 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
COG3Q96JB2 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
COG3Q96JB2 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
COG3Q96JB2 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
COG3Q96JB2 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
COG3Q96JB2 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
COG3Q96JB2 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
COG3Q96JB2 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
COG3Q96JB2 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
COG3Q96JB2 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
COG3Q96JB2 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
COG3Q96JB2 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
COG3Q96JB2 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
COG3Q96JB2 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
COG3Q96JB2 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
COG3Q96JB2 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
COG3Q96JB2 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
COG3Q96JB2 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
COG3Q96JB2 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
COG3Q96JB2 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
COG3Q96JB2 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
COG3Q96JB2 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
COG3Q96JB2 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
COG3Q96JB2 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
COG3Q96JB2 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
COG3Q96JB2 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
COG3Q96JB2 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
COG3Q96JB2 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
COG3Q96JB2 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
COG3Q96JB2 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
COG3Q96JB2 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms