Protein–RNA interactions for Protein: Q92547

TOPBP1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOPBP1Q92547 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TOPBP1Q92547 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TOPBP1Q92547 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TOPBP1Q92547 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TOPBP1Q92547 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TOPBP1Q92547 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TOPBP1Q92547 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TOPBP1Q92547 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TOPBP1Q92547 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TOPBP1Q92547 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
TOPBP1Q92547 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TOPBP1Q92547 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TOPBP1Q92547 AC243967.2-201ENST00000601409 567 ntTSL 4 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TOPBP1Q92547 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TOPBP1Q92547 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TOPBP1Q92547 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TOPBP1Q92547 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TOPBP1Q92547 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TOPBP1Q92547 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TOPBP1Q92547 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TOPBP1Q92547 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TOPBP1Q92547 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TOPBP1Q92547 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TOPBP1Q92547 FXNP2-201ENST00000411625 547 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
TOPBP1Q92547 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TOPBP1Q92547 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TOPBP1Q92547 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
TOPBP1Q92547 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TOPBP1Q92547 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TOPBP1Q92547 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TOPBP1Q92547 AC015967.2-201ENST00000624092 234 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
TOPBP1Q92547 AC006435.4-201ENST00000625037 234 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
TOPBP1Q92547 AL356737.1-201ENST00000634391 234 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
TOPBP1Q92547 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TOPBP1Q92547 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TOPBP1Q92547 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TOPBP1Q92547 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TOPBP1Q92547 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
TOPBP1Q92547 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TOPBP1Q92547 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TOPBP1Q92547 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TOPBP1Q92547 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TOPBP1Q92547 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TOPBP1Q92547 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TOPBP1Q92547 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
TOPBP1Q92547 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TOPBP1Q92547 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TOPBP1Q92547 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TOPBP1Q92547 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TOPBP1Q92547 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TOPBP1Q92547 AC104758.2-201ENST00000562716 483 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TOPBP1Q92547 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
TOPBP1Q92547 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TOPBP1Q92547 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TOPBP1Q92547 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TOPBP1Q92547 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TOPBP1Q92547 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TOPBP1Q92547 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TOPBP1Q92547 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TOPBP1Q92547 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TOPBP1Q92547 ACTR2-205ENST00000542850 1429 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TOPBP1Q92547 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TOPBP1Q92547 MAPK14-204ENST00000468133 1376 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TOPBP1Q92547 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TOPBP1Q92547 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TOPBP1Q92547 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TOPBP1Q92547 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
TOPBP1Q92547 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TOPBP1Q92547 TBC1D16-203ENST00000570373 961 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TOPBP1Q92547 NAT9-224ENST00000583757 583 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TOPBP1Q92547 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TOPBP1Q92547 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TOPBP1Q92547 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TOPBP1Q92547 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TOPBP1Q92547 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TOPBP1Q92547 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TOPBP1Q92547 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TOPBP1Q92547 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TOPBP1Q92547 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TOPBP1Q92547 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TOPBP1Q92547 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TOPBP1Q92547 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TOPBP1Q92547 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TOPBP1Q92547 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TOPBP1Q92547 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TOPBP1Q92547 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TOPBP1Q92547 ZSCAN32-204ENST00000422427 1267 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TOPBP1Q92547 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TOPBP1Q92547 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TOPBP1Q92547 AC074194.1-201ENST00000505025 622 ntTSL 4 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TOPBP1Q92547 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TOPBP1Q92547 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TOPBP1Q92547 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TOPBP1Q92547 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TOPBP1Q92547 AC025810.1-201ENST00000569986 981 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TOPBP1Q92547 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TOPBP1Q92547 AC016629.1-201ENST00000596579 586 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
TOPBP1Q92547 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
TOPBP1Q92547 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TOPBP1Q92547 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.3 ms