Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWQ0

PHIP, PH-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,821 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHIPQ8WWQ0 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PHIPQ8WWQ0 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PHIPQ8WWQ0 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PHIPQ8WWQ0 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
PHIPQ8WWQ0 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PHIPQ8WWQ0 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PHIPQ8WWQ0 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
PHIPQ8WWQ0 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PHIPQ8WWQ0 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PHIPQ8WWQ0 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PHIPQ8WWQ0 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PHIPQ8WWQ0 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
PHIPQ8WWQ0 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PHIPQ8WWQ0 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PHIPQ8WWQ0 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PHIPQ8WWQ0 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PHIPQ8WWQ0 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PHIPQ8WWQ0 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PHIPQ8WWQ0 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PHIPQ8WWQ0 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PHIPQ8WWQ0 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PHIPQ8WWQ0 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PHIPQ8WWQ0 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PHIPQ8WWQ0 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PHIPQ8WWQ0 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PHIPQ8WWQ0 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PHIPQ8WWQ0 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PHIPQ8WWQ0 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PHIPQ8WWQ0 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PHIPQ8WWQ0 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PHIPQ8WWQ0 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PHIPQ8WWQ0 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PHIPQ8WWQ0 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PHIPQ8WWQ0 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PHIPQ8WWQ0 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PHIPQ8WWQ0 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PHIPQ8WWQ0 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PHIPQ8WWQ0 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PHIPQ8WWQ0 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PHIPQ8WWQ0 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PHIPQ8WWQ0 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PHIPQ8WWQ0 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PHIPQ8WWQ0 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PHIPQ8WWQ0 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PHIPQ8WWQ0 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PHIPQ8WWQ0 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PHIPQ8WWQ0 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PHIPQ8WWQ0 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PHIPQ8WWQ0 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PHIPQ8WWQ0 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PHIPQ8WWQ0 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PHIPQ8WWQ0 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PHIPQ8WWQ0 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PHIPQ8WWQ0 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PHIPQ8WWQ0 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PHIPQ8WWQ0 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PHIPQ8WWQ0 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
PHIPQ8WWQ0 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PHIPQ8WWQ0 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
PHIPQ8WWQ0 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
PHIPQ8WWQ0 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
PHIPQ8WWQ0 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
PHIPQ8WWQ0 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PHIPQ8WWQ0 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PHIPQ8WWQ0 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PHIPQ8WWQ0 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PHIPQ8WWQ0 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PHIPQ8WWQ0 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PHIPQ8WWQ0 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PHIPQ8WWQ0 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PHIPQ8WWQ0 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PHIPQ8WWQ0 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PHIPQ8WWQ0 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PHIPQ8WWQ0 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PHIPQ8WWQ0 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PHIPQ8WWQ0 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PHIPQ8WWQ0 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PHIPQ8WWQ0 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PHIPQ8WWQ0 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PHIPQ8WWQ0 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PHIPQ8WWQ0 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PHIPQ8WWQ0 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PHIPQ8WWQ0 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PHIPQ8WWQ0 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PHIPQ8WWQ0 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PHIPQ8WWQ0 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PHIPQ8WWQ0 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PHIPQ8WWQ0 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PHIPQ8WWQ0 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PHIPQ8WWQ0 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PHIPQ8WWQ0 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PHIPQ8WWQ0 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PHIPQ8WWQ0 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PHIPQ8WWQ0 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PHIPQ8WWQ0 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PHIPQ8WWQ0 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
PHIPQ8WWQ0 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PHIPQ8WWQ0 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PHIPQ8WWQ0 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PHIPQ8WWQ0 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms