Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCD3

HJURP, Holliday junction recognition protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HJURPQ8NCD3 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HJURPQ8NCD3 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HJURPQ8NCD3 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HJURPQ8NCD3 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HJURPQ8NCD3 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HJURPQ8NCD3 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HJURPQ8NCD3 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HJURPQ8NCD3 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
HJURPQ8NCD3 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HJURPQ8NCD3 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HJURPQ8NCD3 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HJURPQ8NCD3 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HJURPQ8NCD3 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HJURPQ8NCD3 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HJURPQ8NCD3 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HJURPQ8NCD3 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HJURPQ8NCD3 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HJURPQ8NCD3 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HJURPQ8NCD3 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HJURPQ8NCD3 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HJURPQ8NCD3 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
HJURPQ8NCD3 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HJURPQ8NCD3 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
HJURPQ8NCD3 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HJURPQ8NCD3 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HJURPQ8NCD3 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HJURPQ8NCD3 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HJURPQ8NCD3 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HJURPQ8NCD3 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HJURPQ8NCD3 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HJURPQ8NCD3 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HJURPQ8NCD3 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
HJURPQ8NCD3 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HJURPQ8NCD3 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HJURPQ8NCD3 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HJURPQ8NCD3 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HJURPQ8NCD3 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HJURPQ8NCD3 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HJURPQ8NCD3 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HJURPQ8NCD3 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HJURPQ8NCD3 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HJURPQ8NCD3 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HJURPQ8NCD3 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HJURPQ8NCD3 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HJURPQ8NCD3 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HJURPQ8NCD3 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HJURPQ8NCD3 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
HJURPQ8NCD3 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HJURPQ8NCD3 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HJURPQ8NCD3 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HJURPQ8NCD3 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HJURPQ8NCD3 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
HJURPQ8NCD3 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
HJURPQ8NCD3 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HJURPQ8NCD3 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HJURPQ8NCD3 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HJURPQ8NCD3 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
HJURPQ8NCD3 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HJURPQ8NCD3 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
HJURPQ8NCD3 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
HJURPQ8NCD3 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
HJURPQ8NCD3 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HJURPQ8NCD3 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HJURPQ8NCD3 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HJURPQ8NCD3 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HJURPQ8NCD3 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HJURPQ8NCD3 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HJURPQ8NCD3 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
HJURPQ8NCD3 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HJURPQ8NCD3 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HJURPQ8NCD3 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HJURPQ8NCD3 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HJURPQ8NCD3 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HJURPQ8NCD3 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HJURPQ8NCD3 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HJURPQ8NCD3 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HJURPQ8NCD3 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HJURPQ8NCD3 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HJURPQ8NCD3 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HJURPQ8NCD3 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HJURPQ8NCD3 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
HJURPQ8NCD3 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
HJURPQ8NCD3 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
HJURPQ8NCD3 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
HJURPQ8NCD3 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
HJURPQ8NCD3 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HJURPQ8NCD3 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HJURPQ8NCD3 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HJURPQ8NCD3 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HJURPQ8NCD3 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HJURPQ8NCD3 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HJURPQ8NCD3 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HJURPQ8NCD3 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HJURPQ8NCD3 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HJURPQ8NCD3 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HJURPQ8NCD3 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
HJURPQ8NCD3 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HJURPQ8NCD3 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
HJURPQ8NCD3 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
HJURPQ8NCD3 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.2 ms